13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3109 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3109    100 
 
 		 234 bp  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8708    99.03 
 
 		 600 bp  392  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.393425  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5019  Integrase catalytic region  92.72 
 
 		 1035 bp  289  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679371  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7487  putative transposase  92.96 
 
 		 162 bp  202  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0899    84.43 
 
 		 2433 bp  91.7  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.811127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0900  Integrase catalytic region  84.43 
 
 		 1059 bp  91.7  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1678  Integrase catalytic region  84.43 
 
 		 1059 bp  91.7  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1723    84.43 
 
 		 2793 bp  91.7  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.629246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1724  Integrase catalytic region  84.43 
 
 		 1059 bp  91.7  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1750  Integrase catalytic region  84.43 
 
 		 1059 bp  91.7  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2426  Integrase catalytic region  84.43 
 
 		 1059 bp  91.7  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2742  Integrase catalytic region  84.43 
 
 		 1059 bp  91.7  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0453535  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6430  Integrase catalytic region  82.86 
 
 		 1038 bp  65.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0663611 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>