56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1723 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1524 bp  1683    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  99.06 
 
 		 1467 bp  1620    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1524 bp  1683    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2742  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1059 bp  2099    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0453535  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1524 bp  1683    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2426  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1059 bp  2099    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1524 bp  1683    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1750  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1059 bp  2099    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1724  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1059 bp  2099    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1723    100 
 
 		 2793 bp  5537    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.629246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1678  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1059 bp  2099    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1595    99.13 
 
 		 2911 bp  1750    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.614383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0900  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1059 bp  2099    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0899    100 
 
 		 2433 bp  2438    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.811127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5019  Integrase catalytic region  79.96 
 
 		 1035 bp  190  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679371  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3235  integrase catalytic subunit  82.18 
 
 		 1527 bp  184  9e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6430  Integrase catalytic region  81.48 
 
 		 1038 bp  178  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4777  integrase catalytic region  84.5 
 
 		 633 bp  151  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3165    79.25 
 
 		 878 bp  135  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3109    84.43 
 
 		 234 bp  91.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8708    83.61 
 
 		 600 bp  83.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.393425  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1042  Integrase catalytic region  81.51 
 
 		 1527 bp  75.8  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861303  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0483  integrase catalytic subunit  82.79 
 
 		 1527 bp  75.8  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3365  integrase catalytic subunit  82.79 
 
 		 1527 bp  75.8  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  84.31 
 
 		 1530 bp  75.8  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  84.31 
 
 		 1530 bp  75.8  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4688  Integrase catalytic region  80.82 
 
 		 1527 bp  67.9  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3940  integrase catalytic subunit  85.71 
 
 		 1041 bp  65.9  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1248  integrase catalytic subunit  86.11 
 
 		 1044 bp  63.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113109  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1428  integrase catalytic subunit  86.11 
 
 		 1044 bp  63.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1434  integrase catalytic subunit  86.11 
 
 		 1044 bp  63.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2096  integrase catalytic subunit  86.11 
 
 		 1044 bp  63.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.898918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2098  integrase catalytic subunit  86.11 
 
 		 1044 bp  63.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2208  integrase catalytic subunit  86.11 
 
 		 1044 bp  63.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6928    83.62 
 
 		 237 bp  63.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.768318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1005  Integrase catalytic region  94.59 
 
 		 1050 bp  58  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0155  transposase IstA for insertion sequence IS1326  83.53 
 
 		 1524 bp  58  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.791462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3204  integrase catalytic subunit  82.61 
 
 		 1506 bp  56  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0726    90.91 
 
 		 197 bp  56  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0513719  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3299  integrase catalytic subunit  82.61 
 
 		 1506 bp  56  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0553  putative transposase  90.91 
 
 		 324 bp  56  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0575438  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2556  integrase catalytic subunit  82.61 
 
 		 1506 bp  56  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0004  integrase catalytic subunit  82.61 
 
 		 1506 bp  56  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4956  integrase catalytic subunit  82.61 
 
 		 1506 bp  56  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4866  integrase catalytic subunit  82.61 
 
 		 1506 bp  56  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2899  integrase catalytic subunit  82.61 
 
 		 1506 bp  56  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1699    90.91 
 
 		 324 bp  56  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2051  ChnZ  90.91 
 
 		 288 bp  56  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0627  integrase, catalytic region  90.91 
 
 		 288 bp  56  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000721298  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7487  putative transposase  81.08 
 
 		 162 bp  54  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0683  IS21 family transposase  85.48 
 
 		 1518 bp  52  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1639  IS21 family transposase  85.48 
 
 		 1518 bp  52  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3044  IS21 family transposase  85.48 
 
 		 1518 bp  52  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3403  IS21 family transposase  85.48 
 
 		 1518 bp  52  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3451    86.89 
 
 		 388 bp  50.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1107    93.94 
 
 		 1499 bp  50.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>