23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3165 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009467  Acry_3165    100 
 
 		 878 bp  1740    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  82.33 
 
 		 1524 bp  135  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  79.25 
 
 		 1524 bp  135  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1723    79.25 
 
 		 2793 bp  135  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.629246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1595    82.33 
 
 		 2911 bp  135  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.614383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  79.25 
 
 		 1524 bp  135  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  82.33 
 
 		 1467 bp  135  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  79.25 
 
 		 1524 bp  135  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  82.17 
 
 		 1530 bp  131  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  82.17 
 
 		 1530 bp  131  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1042  Integrase catalytic region  86.18 
 
 		 1527 bp  109  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861303  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4688  Integrase catalytic region  86.14 
 
 		 1527 bp  89.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3365  integrase catalytic subunit  83.74 
 
 		 1527 bp  85.7  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0483  integrase catalytic subunit  83.74 
 
 		 1527 bp  85.7  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3235  integrase catalytic subunit  91.53 
 
 		 1527 bp  77.8  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3304  putative transposase  85.92 
 
 		 1494 bp  61.9  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2997  putative transposase  85.92 
 
 		 1494 bp  61.9  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1464  putative transposase  85.92 
 
 		 1494 bp  61.9  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0155  transposase IstA for insertion sequence IS1326  91.11 
 
 		 1524 bp  58  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.791462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0683  IS21 family transposase  91.11 
 
 		 1518 bp  58  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1639  IS21 family transposase  91.11 
 
 		 1518 bp  58  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3044  IS21 family transposase  91.11 
 
 		 1518 bp  58  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3403  IS21 family transposase  91.11 
 
 		 1518 bp  58  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>