18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6928 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6928    100 
 
 
237 bp  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.768318  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4777  integrase catalytic region  93.1 
 
 
633 bp  333  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0553  putative transposase  85.25 
 
 
324 bp  165  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0575438  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0627  integrase, catalytic region  85.25 
 
 
288 bp  165  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000721298  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2051  ChnZ  85.25 
 
 
288 bp  165  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1699    85.25 
 
 
324 bp  165  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0726    85.25 
 
 
197 bp  165  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0513719  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6430  Integrase catalytic region  84.16 
 
 
1038 bp  147  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0899    83.62 
 
 
2433 bp  63.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.811127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2742  Integrase catalytic region  83.62 
 
 
1059 bp  63.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0453535  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2426  Integrase catalytic region  83.62 
 
 
1059 bp  63.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1750  Integrase catalytic region  83.62 
 
 
1059 bp  63.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719941  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1724  Integrase catalytic region  83.62 
 
 
1059 bp  63.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1723    83.62 
 
 
2793 bp  63.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.629246  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1678  Integrase catalytic region  83.62 
 
 
1059 bp  63.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0900  Integrase catalytic region  83.62 
 
 
1059 bp  63.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5019  Integrase catalytic region  79.75 
 
 
1035 bp  61.9  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679371  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4171    91.43 
 
 
291 bp  46.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.182646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>