More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1434 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1248  integrase catalytic subunit  100 
 
 
347 aa  730    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113109  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1428  integrase catalytic subunit  100 
 
 
347 aa  730    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1434  integrase catalytic subunit  100 
 
 
347 aa  730    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2096  integrase catalytic subunit  100 
 
 
347 aa  730    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.898918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2098  integrase catalytic subunit  100 
 
 
347 aa  730    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2208  integrase catalytic subunit  100 
 
 
347 aa  730    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2033  hypothetical protein  75.82 
 
 
344 aa  548  1e-155  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1763  integrase catalytic subunit  71.55 
 
 
346 aa  521  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3543  ISSod13, transposase  71.86 
 
 
346 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3880  ISSod13, transposase  71.86 
 
 
346 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0119  ISSod13, transposase  71.86 
 
 
346 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0142  ISSod13, transposase  71.86 
 
 
346 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0151  ISSod13, transposase  71.86 
 
 
346 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3580  integrase catalytic subunit  70.09 
 
 
346 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0434  Integrase catalytic region  70.09 
 
 
346 aa  512  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2695  Integrase catalytic region  70.09 
 
 
346 aa  512  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0101379  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2463  Integrase catalytic region  70.09 
 
 
346 aa  512  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3940  integrase catalytic subunit  70.67 
 
 
346 aa  510  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0915  Integrase catalytic region  69.79 
 
 
346 aa  509  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.277682  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3016  Integrase catalytic region  59.82 
 
 
353 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0900  Integrase catalytic region  63.22 
 
 
352 aa  438  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1678  Integrase catalytic region  63.22 
 
 
352 aa  438  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1724  Integrase catalytic region  63.22 
 
 
352 aa  438  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1750  Integrase catalytic region  63.22 
 
 
352 aa  438  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719941  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2426  Integrase catalytic region  63.22 
 
 
352 aa  438  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2742  Integrase catalytic region  63.22 
 
 
352 aa  438  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0453535  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5019  Integrase catalytic region  59.76 
 
 
344 aa  428  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679371  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3516  Integrase catalytic region  61.08 
 
 
350 aa  429  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359482  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0956  hypothetical protein  57.47 
 
 
364 aa  426  1e-118  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0934  hypothetical protein  57.47 
 
 
364 aa  426  1e-118  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0345872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5962  Integrase catalytic region  60.78 
 
 
350 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0884  hypothetical protein  57.47 
 
 
364 aa  426  1e-118  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6430  Integrase catalytic region  59.29 
 
 
345 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2708  Integrase catalytic region  55.43 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0409  Integrase catalytic region  55.43 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2889  Integrase catalytic region  55.43 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0567202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2676  Integrase catalytic region  55.43 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2961  Integrase catalytic region  55.43 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0586  Integrase catalytic region  55.43 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0674484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0220  Integrase catalytic region  55.43 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0338  Integrase catalytic region  55.43 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.465639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1220  Integrase catalytic region  55.43 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1400  Integrase catalytic region  55.43 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000187237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1821  Integrase catalytic region  55.43 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.304505  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1479  Integrase catalytic region  55.43 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1832  Integrase catalytic region  55.43 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.394112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2690  Integrase catalytic region  55.43 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2977  Integrase catalytic region  55.43 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2685  Integrase catalytic region  55.43 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2551  Integrase catalytic region  55.43 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000856867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2553  Integrase catalytic region  55.43 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000502236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1838  Integrase catalytic region  55.43 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2693  Integrase catalytic region  55.43 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0823  Integrase catalytic region  55.43 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1850  Integrase catalytic region  55.43 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2972  Integrase catalytic region  55.43 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0804741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0919  Integrase catalytic region  55.43 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.608605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0589  Integrase catalytic region  55.43 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.02075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2149  Integrase catalytic region  55.13 
 
 
348 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.142732  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0852  integrase catalytic subunit  44.09 
 
 
349 aa  286  4e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.336174  normal  0.0241758 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0877  integrase catalytic subunit  44.09 
 
 
349 aa  286  4e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120135  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4777  integrase catalytic region  62.32 
 
 
210 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1005  Integrase catalytic region  44.13 
 
 
349 aa  276  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0362  integrase, catalytic region  38.34 
 
 
337 aa  228  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.540687  hitchhiker  0.0000859615 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3878  integrase catalytic subunit  38.07 
 
 
344 aa  228  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3186  integrase catalytic subunit  38.34 
 
 
348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3191  integrase catalytic subunit  38.34 
 
 
348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2262  integrase catalytic subunit  38.34 
 
 
348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.512462  normal  0.657223 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3733  integrase catalytic subunit  38.34 
 
 
348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1864  integrase catalytic subunit  38.34 
 
 
348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4480  integrase, catalytic region  35.89 
 
 
357 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000214093 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1966  ISSod13, transposase  39.19 
 
 
291 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00452  predicted DNA-binding transcriptional regulator  63.48 
 
 
123 aa  153  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3110  conserved hypothetical protein  63.48 
 
 
123 aa  153  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00457  hypothetical protein  63.48 
 
 
123 aa  153  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4665  integrase, catalytic region  59.8 
 
 
155 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.599726  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01931  probable transposase protein, Y4bF  38.58 
 
 
494 aa  89.4  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0553  putative transposase  52.63 
 
 
107 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0575438  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3895  iSSod13, transposase  75.47 
 
 
63 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  33.09 
 
 
481 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  27.62 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  27.62 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  27.62 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0552  hypothetical protein  61.82 
 
 
86 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000200918 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  28.25 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2051  ChnZ  53.85 
 
 
95 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  28.25 
 
 
347 aa  80.1  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3007  hypothetical protein  32 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0627  integrase, catalytic region  53.85 
 
 
95 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000721298  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6453  Integrase catalytic region  27.1 
 
 
326 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1052  integrase catalytic subunit  30.52 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1120  integrase catalytic subunit  30.52 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1652  integrase catalytic subunit  30.52 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1068  integrase catalytic subunit  30.52 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1137  integrase catalytic subunit  30.52 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17960  integrase family protein  33.78 
 
 
422 aa  77.8  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  0.82846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4847  Integrase catalytic region  31.82 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0520  putative transposase  24.39 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.693676  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0341  putative transposase  24.39 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24520  integrase family protein  31.82 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>