276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0362 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0362  integrase, catalytic region  100 
 
 		 337 aa  703    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.540687  hitchhiker  0.0000859615 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4480  integrase, catalytic region  71.81 
 
 		 357 aa  513  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000214093 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3878  integrase catalytic subunit  65.77 
 
 		 344 aa  450  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0934  hypothetical protein  39.76 
 
 		 364 aa  268  1e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0345872 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0956  hypothetical protein  39.76 
 
 		 364 aa  268  1e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0884  hypothetical protein  39.76 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1678  Integrase catalytic region  39.27 
 
 		 352 aa  257  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0900  Integrase catalytic region  39.27 
 
 		 352 aa  257  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2426  Integrase catalytic region  39.27 
 
 		 352 aa  257  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1750  Integrase catalytic region  39.27 
 
 		 352 aa  257  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2742  Integrase catalytic region  39.27 
 
 		 352 aa  257  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0453535  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1724  Integrase catalytic region  39.27 
 
 		 352 aa  257  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3516  Integrase catalytic region  37.98 
 
 		 350 aa  252  6e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3016  Integrase catalytic region  37.88 
 
 		 353 aa  249  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5962  Integrase catalytic region  37.69 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6430  Integrase catalytic region  37.94 
 
 		 345 aa  241  9e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5019  Integrase catalytic region  36.86 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679371  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0434  Integrase catalytic region  36.86 
 
 		 346 aa  233  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2695  Integrase catalytic region  36.86 
 
 		 346 aa  233  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0101379  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2463  Integrase catalytic region  36.86 
 
 		 346 aa  233  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0915  Integrase catalytic region  36.56 
 
 		 346 aa  230  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.277682  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2033  hypothetical protein  36.56 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1248  integrase catalytic subunit  38.34 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113109  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1428  integrase catalytic subunit  38.34 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1434  integrase catalytic subunit  38.34 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2096  integrase catalytic subunit  38.34 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.898918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2098  integrase catalytic subunit  38.34 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2208  integrase catalytic subunit  38.34 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3543  ISSod13, transposase  35.95 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3880  ISSod13, transposase  35.95 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0119  ISSod13, transposase  35.95 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0142  ISSod13, transposase  35.95 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0151  ISSod13, transposase  35.95 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1763  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 		 346 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3580  integrase catalytic subunit  35.65 
 
 		 346 aa  225  9e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3940  integrase catalytic subunit  35.95 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2149  Integrase catalytic region  35.82 
 
 		 348 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.142732  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1479  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2977  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2889  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0567202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2708  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2961  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2685  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2690  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2693  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0338  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.465639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1400  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000187237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2972  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0804741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0220  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0586  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0674484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0409  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0823  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0589  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.02075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1220  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0919  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.608605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1821  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.304505  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1832  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.394112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1850  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1838  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2553  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000502236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2551  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000856867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2676  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1864  integrase catalytic subunit  28.44 
 
 		 348 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2262  integrase catalytic subunit  28.44 
 
 		 348 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.512462  normal  0.657223 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3186  integrase catalytic subunit  28.44 
 
 		 348 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3191  integrase catalytic subunit  28.44 
 
 		 348 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3733  integrase catalytic subunit  28.44 
 
 		 348 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0852  integrase catalytic subunit  27.83 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.336174  normal  0.0241758 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0877  integrase catalytic subunit  27.83 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1005  Integrase catalytic region  28.48 
 
 		 349 aa  156  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1966  ISSod13, transposase  27.59 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4777  integrase catalytic region  31.38 
 
 		 210 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00452  predicted DNA-binding transcriptional regulator  42.11 
 
 		 123 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3110  conserved hypothetical protein  42.11 
 
 		 123 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00457  hypothetical protein  42.11 
 
 		 123 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01931  probable transposase protein, Y4bF  39.83 
 
 		 494 aa  85.1  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3007  hypothetical protein  29.24 
 
 		 193 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  24.17 
 
 		 597 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3895  iSSod13, transposase  45.9 
 
 		 63 aa  63.2  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  22.26 
 
 		 481 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2869  Integrase catalytic region  21.98 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.513593  normal  0.876471 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0748  Integrase catalytic region  21.98 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000105818  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1978  Integrase catalytic region  21.98 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal  0.284491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0779  Integrase catalytic region  21.98 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.89745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3167  Integrase catalytic region  21.98 
 
 		 373 aa  59.3  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179309  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0171  Integrase catalytic region  21.98 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2677  Integrase catalytic region  21.98 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000537558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0321  Integrase catalytic region  21.98 
 
 		 373 aa  59.3  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1990  Integrase catalytic region  21.98 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0292285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2198  Integrase catalytic region  21.98 
 
 		 364 aa  59.7  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1394  Integrase catalytic region  22.96 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.295612  normal  0.0489416 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1702  Integrase catalytic region  21.98 
 
 		 364 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.431472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2491  Integrase catalytic region  21.98 
 
 		 378 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0709755 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1152  Integrase catalytic region  21.98 
 
 		 378 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1159  Integrase catalytic region  21.98 
 
 		 358 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.565735  decreased coverage  0.00186464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2485  Integrase catalytic region  22.96 
 
 		 364 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.151437 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0729  Integrase catalytic region  21.98 
 
 		 378 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00154402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0876  Integrase catalytic region  21.98 
 
 		 367 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.506232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1238  Integrase catalytic region  21.98 
 
 		 378 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0115541  normal  0.0835857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2064  Integrase catalytic region  21.98 
 
 		 365 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.654587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>