235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4480 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4480  integrase, catalytic region  100 
 
 		 357 aa  748    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000214093 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0362  integrase, catalytic region  71.81 
 
 		 337 aa  513  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.540687  hitchhiker  0.0000859615 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3878  integrase catalytic subunit  68.45 
 
 		 344 aa  479  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0934  hypothetical protein  39.47 
 
 		 364 aa  255  7e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0345872 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0956  hypothetical protein  39.47 
 
 		 364 aa  255  7e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0884  hypothetical protein  39.47 
 
 		 364 aa  255  8e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3016  Integrase catalytic region  38.28 
 
 		 353 aa  249  7e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3516  Integrase catalytic region  37.94 
 
 		 350 aa  237  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2742  Integrase catalytic region  36.31 
 
 		 352 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0453535  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2426  Integrase catalytic region  36.31 
 
 		 352 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1750  Integrase catalytic region  36.31 
 
 		 352 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1724  Integrase catalytic region  36.31 
 
 		 352 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0900  Integrase catalytic region  36.31 
 
 		 352 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1678  Integrase catalytic region  36.31 
 
 		 352 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5962  Integrase catalytic region  37.65 
 
 		 350 aa  233  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5019  Integrase catalytic region  36.86 
 
 		 344 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679371  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6430  Integrase catalytic region  37.08 
 
 		 345 aa  228  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3543  ISSod13, transposase  35.01 
 
 		 346 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3880  ISSod13, transposase  35.01 
 
 		 346 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0119  ISSod13, transposase  35.01 
 
 		 346 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0142  ISSod13, transposase  35.01 
 
 		 346 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0151  ISSod13, transposase  35.01 
 
 		 346 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0434  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2463  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2695  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0101379  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3940  integrase catalytic subunit  35.84 
 
 		 346 aa  220  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3580  integrase catalytic subunit  35.52 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0915  Integrase catalytic region  35.24 
 
 		 346 aa  217  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.277682  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1248  integrase catalytic subunit  35.89 
 
 		 347 aa  218  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113109  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1428  integrase catalytic subunit  35.89 
 
 		 347 aa  218  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1434  integrase catalytic subunit  35.89 
 
 		 347 aa  218  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2096  integrase catalytic subunit  35.89 
 
 		 347 aa  218  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.898918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2098  integrase catalytic subunit  35.89 
 
 		 347 aa  218  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2208  integrase catalytic subunit  35.89 
 
 		 347 aa  218  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2033  hypothetical protein  34.85 
 
 		 344 aa  214  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1763  integrase catalytic subunit  34.94 
 
 		 346 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2149  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 348 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.142732  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0589  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.02075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2972  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0804741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0220  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0586  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0674484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2977  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1832  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.394112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1821  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.304505  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1850  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2551  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000856867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1838  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2676  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2690  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2685  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2553  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000502236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2708  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2693  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2961  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2889  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0567202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1400  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000187237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1220  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0919  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.608605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1479  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0823  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0338  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.465639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0409  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0852  integrase catalytic subunit  30.51 
 
 		 349 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.336174  normal  0.0241758 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0877  integrase catalytic subunit  30.51 
 
 		 349 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1005  Integrase catalytic region  30.51 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1864  integrase catalytic subunit  27.3 
 
 		 348 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2262  integrase catalytic subunit  27.3 
 
 		 348 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.512462  normal  0.657223 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3186  integrase catalytic subunit  27.3 
 
 		 348 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3733  integrase catalytic subunit  27.3 
 
 		 348 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3191  integrase catalytic subunit  27.3 
 
 		 348 aa  143  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00452  predicted DNA-binding transcriptional regulator  47.37 
 
 		 123 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3110  conserved hypothetical protein  47.37 
 
 		 123 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00457  hypothetical protein  47.37 
 
 		 123 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1966  ISSod13, transposase  27.41 
 
 		 291 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4777  integrase catalytic region  33.71 
 
 		 210 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01931  probable transposase protein, Y4bF  39.2 
 
 		 494 aa  84.3  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3007  hypothetical protein  27.01 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1052  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1120  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1652  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1068  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1137  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2869  Integrase catalytic region  24.46 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.513593  normal  0.876471 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2491  Integrase catalytic region  24.46 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0709755 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1238  Integrase catalytic region  24.46 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0115541  normal  0.0835857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2732  Integrase catalytic region  24.46 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0729  Integrase catalytic region  24.46 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00154402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2714  Integrase catalytic region  24.46 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal  0.786621 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1564  Integrase catalytic region  24.46 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1152  Integrase catalytic region  24.46 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0088  Integrase catalytic region  24.69 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2677  Integrase catalytic region  24.46 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000537558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1815  Integrase catalytic region  24.46 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1978  Integrase catalytic region  24.46 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal  0.284491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3016  Integrase catalytic region  24.46 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2762  Integrase catalytic region  24.69 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3091  Integrase catalytic region  24.46 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0808941 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0891  Integrase catalytic region  24.46 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.233948  normal  0.0447709 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2429  Integrase catalytic region  24.46 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0779  Integrase catalytic region  24.16 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.89745  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>