More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1052 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_1137  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 358 aa  739    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1068  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 358 aa  741    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1052  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 358 aa  741    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1120  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 358 aa  739    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1652  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 358 aa  739    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  69.25 
 
 		 481 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22790  integrase family protein  68.94 
 
 		 318 aa  457  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.582156  normal  0.782085 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24520  integrase family protein  61.49 
 
 		 328 aa  410  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4847  Integrase catalytic region  60 
 
 		 328 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4349  transposase  54.19 
 
 		 329 aa  348  9e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1813  Integrase catalytic region  53.59 
 
 		 332 aa  343  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1107  Integrase catalytic region  53.59 
 
 		 332 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.528266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1510  integrase catalytic subunit  50.88 
 
 		 325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1272  integrase catalytic subunit  51.5 
 
 		 329 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1255  integrase catalytic subunit  51.5 
 
 		 329 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2416  integrase catalytic subunit  51.5 
 
 		 329 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571149  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4313  integrase catalytic subunit  51.24 
 
 		 309 aa  306  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0419733  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17960  integrase family protein  59.18 
 
 		 422 aa  303  4.0000000000000003e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  0.82846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0287  Integrase catalytic region  43.67 
 
 		 318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1133  Integrase catalytic region  43.67 
 
 		 318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1036  Integrase catalytic region  43.67 
 
 		 318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  44.72 
 
 		 347 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  45.95 
 
 		 330 aa  246  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  45.95 
 
 		 330 aa  246  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  45.95 
 
 		 330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  45.66 
 
 		 330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2591  integrase catalytic subunit  42.77 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4011  integrase catalytic subunit  42.77 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2546  integrase catalytic subunit  42.77 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303835  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3937  integrase catalytic subunit  42.77 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3720  integrase catalytic subunit  42.77 
 
 		 333 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158828  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3793  integrase catalytic subunit  42.56 
 
 		 321 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338369  normal  0.128891 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0179  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 		 315 aa  222  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3658  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 		 315 aa  222  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4025  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 		 315 aa  222  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4504  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 		 315 aa  222  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0485  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 		 315 aa  222  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4598  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 		 315 aa  222  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0549  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 		 315 aa  222  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2137  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 		 315 aa  222  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4445  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 		 315 aa  222  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.730618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0673  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 		 315 aa  222  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2560  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 		 315 aa  222  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278482  decreased coverage  0.00231503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1870  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 		 315 aa  222  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1990  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 		 315 aa  222  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2654  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 		 315 aa  222  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  0.067102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3394  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 		 315 aa  222  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3207  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 		 315 aa  222  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2979  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 		 315 aa  222  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161528  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_004310  BR0513  ISBm3, transposase, programmed frameshift  41.23 
 
 		 313 aa  222  9e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3352  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 		 315 aa  222  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3424  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 		 315 aa  222  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821983 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1534  integrase catalytic subunit  41.95 
 
 		 341 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1511  integrase catalytic subunit  41.95 
 
 		 341 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  39.17 
 
 		 314 aa  215  8e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  39.17 
 
 		 314 aa  215  8e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  39.17 
 
 		 314 aa  215  9e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  39.17 
 
 		 314 aa  215  9e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  39.17 
 
 		 314 aa  215  9e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  41.59 
 
 		 316 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  41.9 
 
 		 316 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  41.9 
 
 		 316 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  41.9 
 
 		 316 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  41.9 
 
 		 316 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  40.98 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0754  integrase catalytic subunit  37.85 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05300  transposase  37.13 
 
 		 335 aa  189  5e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18440  hypothetical protein  70.77 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0765744  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3283  Integrase catalytic region  36.47 
 
 		 351 aa  186  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3687  Integrase catalytic region  36.47 
 
 		 351 aa  186  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14260  transposase  36.83 
 
 		 335 aa  185  8e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00196593  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21500  transposase  36.53 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3273  Integrase catalytic region  36.76 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1610  Integrase catalytic region  36.76 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1334  Integrase catalytic region  37.06 
 
 		 335 aa  179  7e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.661987  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0797  Integrase catalytic region  36.47 
 
 		 335 aa  177  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23770  integrase family protein  36.87 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03170  transposase  35.99 
 
 		 320 aa  169  5e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11870  transposase  35.93 
 
 		 365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0489  transposase  37.91 
 
 		 195 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50600  transposase  28.24 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138059  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5281  histidine kinase  62.5 
 
 		 151 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.263883  normal  0.386303 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5727  histidine kinase  62.5 
 
 		 151 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.21896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09100  Integrase, catalytic domain-containing protein  28.24 
 
 		 381 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.387294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11320  Integrase, catalytic domain-containing protein  28.24 
 
 		 381 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15790  Integrase, catalytic domain-containing protein  28.24 
 
 		 381 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  28.24 
 
 		 381 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  28.24 
 
 		 381 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33550  transposase  28.24 
 
 		 381 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7250  Integrase catalytic region  32.53 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1525  Integrase catalytic region  32.53 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0129  Integrase catalytic region  32.53 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162314  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0541  putative transposase integrase  27.49 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3643  putative transposase  27.49 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4261  putative transposase  27.49 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4349  putative transposase  27.49 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.732851  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4350  putative transposase  27.49 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  0.302741 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3338  Integrase catalytic region  29.97 
 
 		 380 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858997  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1250  Integrase catalytic region  28.31 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0339  Integrase catalytic region  28.31 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>