More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0852 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0852  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 349 aa  722    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.336174  normal  0.0241758 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0877  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 349 aa  722    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1005  Integrase catalytic region  73.35 
 
 		 349 aa  528  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0220  Integrase catalytic region  46.45 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1832  Integrase catalytic region  46.45 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.394112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0823  Integrase catalytic region  46.45 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1850  Integrase catalytic region  46.45 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0338  Integrase catalytic region  46.45 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.465639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0589  Integrase catalytic region  46.45 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.02075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1400  Integrase catalytic region  46.45 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000187237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1479  Integrase catalytic region  46.45 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1821  Integrase catalytic region  46.45 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.304505  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2676  Integrase catalytic region  46.45 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1838  Integrase catalytic region  46.45 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2553  Integrase catalytic region  46.45 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000502236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2685  Integrase catalytic region  46.45 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2551  Integrase catalytic region  46.45 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000856867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2972  Integrase catalytic region  46.45 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0804741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0409  Integrase catalytic region  46.45 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0586  Integrase catalytic region  46.45 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0674484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1220  Integrase catalytic region  46.45 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2690  Integrase catalytic region  46.45 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2977  Integrase catalytic region  46.45 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0919  Integrase catalytic region  46.45 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.608605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2693  Integrase catalytic region  46.45 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2889  Integrase catalytic region  46.45 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0567202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2708  Integrase catalytic region  46.45 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2961  Integrase catalytic region  46.45 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2149  Integrase catalytic region  46.15 
 
 		 348 aa  318  1e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.142732  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1864  integrase catalytic subunit  47.55 
 
 		 348 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2262  integrase catalytic subunit  47.55 
 
 		 348 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.512462  normal  0.657223 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3186  integrase catalytic subunit  47.55 
 
 		 348 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3191  integrase catalytic subunit  47.55 
 
 		 348 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3733  integrase catalytic subunit  47.55 
 
 		 348 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1248  integrase catalytic subunit  44.11 
 
 		 347 aa  301  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113109  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1428  integrase catalytic subunit  44.11 
 
 		 347 aa  301  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1434  integrase catalytic subunit  44.11 
 
 		 347 aa  301  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2096  integrase catalytic subunit  44.11 
 
 		 347 aa  301  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.898918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2098  integrase catalytic subunit  44.11 
 
 		 347 aa  301  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2208  integrase catalytic subunit  44.11 
 
 		 347 aa  301  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2033  hypothetical protein  43.33 
 
 		 344 aa  298  8e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1724  Integrase catalytic region  44.91 
 
 		 352 aa  297  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1678  Integrase catalytic region  44.91 
 
 		 352 aa  297  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2426  Integrase catalytic region  44.91 
 
 		 352 aa  297  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2742  Integrase catalytic region  44.91 
 
 		 352 aa  297  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0453535  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1750  Integrase catalytic region  44.91 
 
 		 352 aa  297  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0900  Integrase catalytic region  44.91 
 
 		 352 aa  297  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6430  Integrase catalytic region  44.21 
 
 		 345 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1763  integrase catalytic subunit  42.94 
 
 		 346 aa  292  6e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3580  integrase catalytic subunit  42.64 
 
 		 346 aa  287  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0434  Integrase catalytic region  43.54 
 
 		 346 aa  286  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2463  Integrase catalytic region  43.54 
 
 		 346 aa  286  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5019  Integrase catalytic region  43.62 
 
 		 344 aa  286  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679371  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2695  Integrase catalytic region  43.54 
 
 		 346 aa  286  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0101379  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3543  ISSod13, transposase  42.55 
 
 		 346 aa  286  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3880  ISSod13, transposase  42.55 
 
 		 346 aa  286  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0119  ISSod13, transposase  42.55 
 
 		 346 aa  286  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0142  ISSod13, transposase  42.55 
 
 		 346 aa  286  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0151  ISSod13, transposase  42.55 
 
 		 346 aa  286  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0915  Integrase catalytic region  43.24 
 
 		 346 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.277682  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0934  hypothetical protein  42.22 
 
 		 364 aa  281  1e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0345872 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0956  hypothetical protein  42.22 
 
 		 364 aa  281  1e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0884  hypothetical protein  42.22 
 
 		 364 aa  281  1e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3940  integrase catalytic subunit  42.99 
 
 		 346 aa  280  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3516  Integrase catalytic region  42.34 
 
 		 350 aa  278  8e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3016  Integrase catalytic region  41.02 
 
 		 353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5962  Integrase catalytic region  42.04 
 
 		 350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1966  ISSod13, transposase  46.1 
 
 		 291 aa  255  6e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4777  integrase catalytic region  47.5 
 
 		 210 aa  199  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3878  integrase catalytic subunit  31.5 
 
 		 344 aa  178  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4480  integrase, catalytic region  30.51 
 
 		 357 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000214093 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0362  integrase, catalytic region  29 
 
 		 337 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.540687  hitchhiker  0.0000859615 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3007  hypothetical protein  42.86 
 
 		 193 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1510  integrase catalytic subunit  32.78 
 
 		 325 aa  97.1  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4313  integrase catalytic subunit  32.65 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0419733  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00452  predicted DNA-binding transcriptional regulator  46.36 
 
 		 123 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3110  conserved hypothetical protein  46.36 
 
 		 123 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00457  hypothetical protein  46.36 
 
 		 123 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  28.24 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  28.24 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  28.24 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  26.65 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  26.65 
 
 		 347 aa  82.4  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  26.02 
 
 		 597 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1052  integrase catalytic subunit  36.59 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1120  integrase catalytic subunit  36.59 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1652  integrase catalytic subunit  36.59 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1068  integrase catalytic subunit  36.59 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1137  integrase catalytic subunit  36.59 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  35.71 
 
 		 481 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  27.02 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1255  integrase catalytic subunit  28.34 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2416  integrase catalytic subunit  28.34 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571149  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1272  integrase catalytic subunit  28.34 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1813  Integrase catalytic region  36.23 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  32.37 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1107  Integrase catalytic region  36.23 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.528266 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1238  Integrase catalytic region  27.4 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00285925  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0398  Integrase catalytic region  27.56 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00305387  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  33.33 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.437302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>