More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1966 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1966  ISSod13, transposase  100 
 
 		 291 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1864  integrase catalytic subunit  99.3 
 
 		 348 aa  588  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2262  integrase catalytic subunit  99.3 
 
 		 348 aa  588  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.512462  normal  0.657223 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3186  integrase catalytic subunit  99.3 
 
 		 348 aa  588  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3191  integrase catalytic subunit  99.3 
 
 		 348 aa  588  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3733  integrase catalytic subunit  99.3 
 
 		 348 aa  588  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3007  hypothetical protein  99.21 
 
 		 193 aa  261  8e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0852  integrase catalytic subunit  45.2 
 
 		 349 aa  255  7e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.336174  normal  0.0241758 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0877  integrase catalytic subunit  45.2 
 
 		 349 aa  255  7e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1005  Integrase catalytic region  45.09 
 
 		 349 aa  249  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2977  Integrase catalytic region  39.93 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0823  Integrase catalytic region  39.93 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2553  Integrase catalytic region  39.93 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000502236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1850  Integrase catalytic region  39.93 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0338  Integrase catalytic region  39.93 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.465639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2551  Integrase catalytic region  39.93 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000856867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2676  Integrase catalytic region  39.93 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1838  Integrase catalytic region  39.93 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1400  Integrase catalytic region  39.93 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000187237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1220  Integrase catalytic region  39.93 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0919  Integrase catalytic region  39.93 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.608605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0589  Integrase catalytic region  39.93 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.02075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1479  Integrase catalytic region  39.93 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1832  Integrase catalytic region  39.93 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.394112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2708  Integrase catalytic region  39.93 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2889  Integrase catalytic region  39.93 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0567202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2961  Integrase catalytic region  39.93 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0220  Integrase catalytic region  39.93 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2690  Integrase catalytic region  39.93 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2972  Integrase catalytic region  39.93 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0804741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2685  Integrase catalytic region  39.93 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1821  Integrase catalytic region  39.93 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.304505  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0586  Integrase catalytic region  39.93 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0674484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0409  Integrase catalytic region  39.93 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2693  Integrase catalytic region  39.93 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2033  hypothetical protein  41.7 
 
 		 344 aa  206  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3543  ISSod13, transposase  42.69 
 
 		 346 aa  205  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3880  ISSod13, transposase  42.69 
 
 		 346 aa  205  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0119  ISSod13, transposase  42.69 
 
 		 346 aa  205  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0142  ISSod13, transposase  42.69 
 
 		 346 aa  205  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0151  ISSod13, transposase  42.69 
 
 		 346 aa  205  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2149  Integrase catalytic region  39.55 
 
 		 348 aa  205  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.142732  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1763  integrase catalytic subunit  42.15 
 
 		 346 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2742  Integrase catalytic region  40.36 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0453535  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1678  Integrase catalytic region  40.36 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0900  Integrase catalytic region  40.36 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1724  Integrase catalytic region  40.36 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1750  Integrase catalytic region  40.36 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2426  Integrase catalytic region  40.36 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6430  Integrase catalytic region  41.73 
 
 		 345 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3580  integrase catalytic subunit  40.77 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0434  Integrase catalytic region  40.23 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2463  Integrase catalytic region  40.23 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2695  Integrase catalytic region  40.23 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0101379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5962  Integrase catalytic region  38.41 
 
 		 350 aa  196  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3516  Integrase catalytic region  38.41 
 
 		 350 aa  195  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0915  Integrase catalytic region  39.85 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.277682  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3940  integrase catalytic subunit  40 
 
 		 346 aa  192  7e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1248  integrase catalytic subunit  39.19 
 
 		 347 aa  188  8e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113109  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1428  integrase catalytic subunit  39.19 
 
 		 347 aa  188  8e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1434  integrase catalytic subunit  39.19 
 
 		 347 aa  188  8e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2096  integrase catalytic subunit  39.19 
 
 		 347 aa  188  8e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.898918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2098  integrase catalytic subunit  39.19 
 
 		 347 aa  188  8e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2208  integrase catalytic subunit  39.19 
 
 		 347 aa  188  8e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5019  Integrase catalytic region  39.78 
 
 		 344 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679371  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3016  Integrase catalytic region  36.56 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0956  hypothetical protein  38.17 
 
 		 364 aa  180  2e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0934  hypothetical protein  38.17 
 
 		 364 aa  180  2e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0345872 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0884  hypothetical protein  37.79 
 
 		 364 aa  177  2e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4777  integrase catalytic region  47.43 
 
 		 210 aa  175  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0362  integrase, catalytic region  27.59 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.540687  hitchhiker  0.0000859615 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4480  integrase, catalytic region  27.41 
 
 		 357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000214093 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3878  integrase catalytic subunit  27.38 
 
 		 344 aa  102  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  33.97 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  33.97 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  33.97 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  33.97 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  33.97 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  27.1 
 
 		 597 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0754  integrase catalytic subunit  32.37 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  27.46 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  27.51 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  27.51 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  27.51 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  27.46 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1990  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2137  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2560  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278482  decreased coverage  0.00231503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2654  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  0.067102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2979  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161528  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3207  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3352  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3394  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3424  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3658  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4025  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4445  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.730618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4504  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4598  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  27.46 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>