More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3580 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3543  ISSod13, transposase  85.55 
 
 		 346 aa  635    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3880  ISSod13, transposase  85.55 
 
 		 346 aa  635    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0119  ISSod13, transposase  85.55 
 
 		 346 aa  635    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0142  ISSod13, transposase  85.55 
 
 		 346 aa  635    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0151  ISSod13, transposase  85.55 
 
 		 346 aa  635    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3580  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 346 aa  724    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2463  Integrase catalytic region  83.82 
 
 		 346 aa  632  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0434  Integrase catalytic region  83.82 
 
 		 346 aa  632  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2695  Integrase catalytic region  83.82 
 
 		 346 aa  632  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0101379  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0915  Integrase catalytic region  83.53 
 
 		 346 aa  629  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.277682  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1763  integrase catalytic subunit  84.1 
 
 		 346 aa  626  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3940  integrase catalytic subunit  83.24 
 
 		 346 aa  618  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2033  hypothetical protein  79.77 
 
 		 344 aa  583  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1248  integrase catalytic subunit  70.09 
 
 		 347 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113109  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1428  integrase catalytic subunit  70.09 
 
 		 347 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1434  integrase catalytic subunit  70.09 
 
 		 347 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2096  integrase catalytic subunit  70.09 
 
 		 347 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.898918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2098  integrase catalytic subunit  70.09 
 
 		 347 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2208  integrase catalytic subunit  70.09 
 
 		 347 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3016  Integrase catalytic region  62.68 
 
 		 353 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3516  Integrase catalytic region  62.1 
 
 		 350 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5962  Integrase catalytic region  61.81 
 
 		 350 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1678  Integrase catalytic region  62.46 
 
 		 352 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1724  Integrase catalytic region  62.46 
 
 		 352 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2742  Integrase catalytic region  62.46 
 
 		 352 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0453535  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2426  Integrase catalytic region  62.46 
 
 		 352 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0900  Integrase catalytic region  62.46 
 
 		 352 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1750  Integrase catalytic region  62.46 
 
 		 352 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0934  hypothetical protein  60.06 
 
 		 364 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0345872 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0956  hypothetical protein  60.06 
 
 		 364 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0884  hypothetical protein  60.06 
 
 		 364 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6430  Integrase catalytic region  59.4 
 
 		 345 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2149  Integrase catalytic region  58.16 
 
 		 348 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.142732  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0409  Integrase catalytic region  58.46 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2708  Integrase catalytic region  58.46 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2693  Integrase catalytic region  58.46 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0919  Integrase catalytic region  58.46 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.608605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2972  Integrase catalytic region  58.46 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0804741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2961  Integrase catalytic region  58.46 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2977  Integrase catalytic region  58.46 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2889  Integrase catalytic region  58.46 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0567202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0338  Integrase catalytic region  58.46 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.465639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0220  Integrase catalytic region  58.46 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0589  Integrase catalytic region  58.46 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.02075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0823  Integrase catalytic region  58.46 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0586  Integrase catalytic region  58.46 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0674484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1821  Integrase catalytic region  58.46 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.304505  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2690  Integrase catalytic region  58.46 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1220  Integrase catalytic region  58.46 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2551  Integrase catalytic region  58.46 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000856867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1838  Integrase catalytic region  58.46 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5019  Integrase catalytic region  57.57 
 
 		 344 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679371  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2553  Integrase catalytic region  58.46 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000502236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1832  Integrase catalytic region  58.46 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.394112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2676  Integrase catalytic region  58.46 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1850  Integrase catalytic region  58.46 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2685  Integrase catalytic region  58.46 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1479  Integrase catalytic region  58.46 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1400  Integrase catalytic region  58.46 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000187237  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4777  integrase catalytic region  65.05 
 
 		 210 aa  298  9e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0852  integrase catalytic subunit  42.81 
 
 		 349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.336174  normal  0.0241758 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0877  integrase catalytic subunit  42.81 
 
 		 349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1005  Integrase catalytic region  42.81 
 
 		 349 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0362  integrase, catalytic region  35.65 
 
 		 337 aa  225  9e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.540687  hitchhiker  0.0000859615 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2262  integrase catalytic subunit  37.05 
 
 		 348 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.512462  normal  0.657223 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3733  integrase catalytic subunit  37.05 
 
 		 348 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3186  integrase catalytic subunit  37.05 
 
 		 348 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1864  integrase catalytic subunit  37.05 
 
 		 348 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3191  integrase catalytic subunit  37.05 
 
 		 348 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4480  integrase, catalytic region  35.52 
 
 		 357 aa  218  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000214093 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3878  integrase catalytic subunit  37.23 
 
 		 344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00452  predicted DNA-binding transcriptional regulator  75.41 
 
 		 123 aa  206  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3110  conserved hypothetical protein  75.41 
 
 		 123 aa  206  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00457  hypothetical protein  75.41 
 
 		 123 aa  206  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1966  ISSod13, transposase  40.77 
 
 		 291 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4665  integrase, catalytic region  59.09 
 
 		 155 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.599726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3895  iSSod13, transposase  81.67 
 
 		 63 aa  106  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1113  hypothetical protein  70.97 
 
 		 67 aa  94  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00831584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0553  putative transposase  49.35 
 
 		 107 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0575438  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01931  probable transposase protein, Y4bF  40.68 
 
 		 494 aa  85.9  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0552  hypothetical protein  56.67 
 
 		 86 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000200918 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2051  ChnZ  49.23 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0627  integrase, catalytic region  49.23 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000721298  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3007  hypothetical protein  31.11 
 
 		 193 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17960  integrase family protein  27.73 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  0.82846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  28.29 
 
 		 481 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0341  putative transposase  25.45 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0520  putative transposase  25.45 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.693676  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24520  integrase family protein  26.72 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0615  integrase catalytic subunit  26.69 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1497  Integrase catalytic region  24.27 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  hitchhiker  0.000449962 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2491  Integrase catalytic region  24.27 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0709755 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2198  Integrase catalytic region  24.27 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1815  Integrase catalytic region  24.05 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0896  Integrase catalytic region  24.27 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.366884  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1152  Integrase catalytic region  24.27 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1564  Integrase catalytic region  24.27 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1978  Integrase catalytic region  24.27 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal  0.284491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1238  Integrase catalytic region  24.27 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0115541  normal  0.0835857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0729  Integrase catalytic region  24.27 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00154402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>