197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3007 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3007  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3191  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 348 aa  394  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1864  integrase catalytic subunit  99.48 
 
 		 348 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2262  integrase catalytic subunit  99.48 
 
 		 348 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.512462  normal  0.657223 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3186  integrase catalytic subunit  99.48 
 
 		 348 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3733  integrase catalytic subunit  99.48 
 
 		 348 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1966  ISSod13, transposase  99.21 
 
 		 291 aa  261  4e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0852  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 		 349 aa  124  6e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.336174  normal  0.0241758 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0877  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 		 349 aa  124  6e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1005  Integrase catalytic region  40.51 
 
 		 349 aa  122  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2690  Integrase catalytic region  33.71 
 
 		 348 aa  98.6  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2685  Integrase catalytic region  33.71 
 
 		 348 aa  98.6  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2708  Integrase catalytic region  33.71 
 
 		 348 aa  98.6  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2961  Integrase catalytic region  33.71 
 
 		 348 aa  98.6  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2889  Integrase catalytic region  33.71 
 
 		 348 aa  98.6  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0567202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2693  Integrase catalytic region  33.71 
 
 		 348 aa  98.6  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2676  Integrase catalytic region  33.71 
 
 		 348 aa  98.6  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2553  Integrase catalytic region  33.71 
 
 		 348 aa  98.6  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000502236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2551  Integrase catalytic region  33.71 
 
 		 348 aa  98.6  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000856867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2977  Integrase catalytic region  33.71 
 
 		 348 aa  98.6  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2972  Integrase catalytic region  33.71 
 
 		 348 aa  98.6  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0804741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2149  Integrase catalytic region  33.71 
 
 		 348 aa  98.6  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.142732  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0220  Integrase catalytic region  33.71 
 
 		 348 aa  98.6  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0338  Integrase catalytic region  33.71 
 
 		 348 aa  98.6  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.465639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0409  Integrase catalytic region  33.71 
 
 		 348 aa  98.6  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0586  Integrase catalytic region  33.71 
 
 		 348 aa  98.6  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0674484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0589  Integrase catalytic region  33.71 
 
 		 348 aa  98.6  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.02075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0823  Integrase catalytic region  33.71 
 
 		 348 aa  98.6  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0919  Integrase catalytic region  33.71 
 
 		 348 aa  98.6  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.608605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1220  Integrase catalytic region  33.71 
 
 		 348 aa  98.6  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1400  Integrase catalytic region  33.71 
 
 		 348 aa  98.6  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000187237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1479  Integrase catalytic region  33.71 
 
 		 348 aa  98.6  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1821  Integrase catalytic region  33.71 
 
 		 348 aa  98.6  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.304505  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1832  Integrase catalytic region  33.71 
 
 		 348 aa  98.6  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.394112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1838  Integrase catalytic region  33.71 
 
 		 348 aa  98.6  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1850  Integrase catalytic region  33.71 
 
 		 348 aa  98.6  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0884  hypothetical protein  34.27 
 
 		 364 aa  95.1  6e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0934  hypothetical protein  34.27 
 
 		 364 aa  95.1  6e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0345872 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0956  hypothetical protein  34.27 
 
 		 364 aa  95.1  6e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2033  hypothetical protein  35.71 
 
 		 344 aa  92.4  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0900  Integrase catalytic region  34.62 
 
 		 352 aa  90.9  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1678  Integrase catalytic region  34.62 
 
 		 352 aa  90.9  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1724  Integrase catalytic region  34.62 
 
 		 352 aa  90.9  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1750  Integrase catalytic region  34.62 
 
 		 352 aa  90.9  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2426  Integrase catalytic region  34.62 
 
 		 352 aa  90.9  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2742  Integrase catalytic region  34.62 
 
 		 352 aa  90.9  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0453535  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5019  Integrase catalytic region  34.27 
 
 		 344 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679371  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6430  Integrase catalytic region  33.52 
 
 		 345 aa  87  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1763  integrase catalytic subunit  33.9 
 
 		 346 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3516  Integrase catalytic region  32.6 
 
 		 350 aa  85.5  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1530  hypothetical protein  75.47 
 
 		 79 aa  85.1  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0383954 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2695  Integrase catalytic region  31.61 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0101379  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0434  Integrase catalytic region  31.61 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0915  Integrase catalytic region  31.61 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.277682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2463  Integrase catalytic region  31.61 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3016  Integrase catalytic region  33.15 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5962  Integrase catalytic region  32.04 
 
 		 350 aa  81.6  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0362  integrase, catalytic region  29.24 
 
 		 337 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.540687  hitchhiker  0.0000859615 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3543  ISSod13, transposase  32.43 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3880  ISSod13, transposase  32.43 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0119  ISSod13, transposase  32.43 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0142  ISSod13, transposase  32.43 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0151  ISSod13, transposase  32.43 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3940  integrase catalytic subunit  31.69 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1248  integrase catalytic subunit  32 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113109  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1428  integrase catalytic subunit  32 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1434  integrase catalytic subunit  32 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2096  integrase catalytic subunit  32 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.898918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2098  integrase catalytic subunit  32 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2208  integrase catalytic subunit  32 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3580  integrase catalytic subunit  31.11 
 
 		 346 aa  79  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3878  integrase catalytic subunit  29.61 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4480  integrase, catalytic region  27.01 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000214093 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50600  transposase  35.71 
 
 		 381 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11320  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.92 
 
 		 381 aa  55.5  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09100  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.92 
 
 		 381 aa  55.5  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.387294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.92 
 
 		 381 aa  55.5  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15790  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.92 
 
 		 381 aa  55.5  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33550  transposase  34.92 
 
 		 381 aa  55.5  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.92 
 
 		 381 aa  55.5  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2234  Integrase catalytic region  28.03 
 
 		 402 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.715682  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4351  Integrase catalytic region  28.03 
 
 		 402 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2172  Integrase catalytic region  28.03 
 
 		 402 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0104319  normal  0.0206375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1246  Integrase catalytic region  28.03 
 
 		 402 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0188803  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1602  Integrase catalytic region  30.97 
 
 		 607 aa  50.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.090134  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0886  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 324 aa  48.5  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2282  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 324 aa  48.5  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0155582  normal  0.016893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2281  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 324 aa  48.5  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00884942  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2662  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 324 aa  48.5  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0870551 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0784  feruloyl esterase  31.52 
 
 		 346 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3895  iSSod13, transposase  38 
 
 		 63 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1806  Integrase catalytic region  25.13 
 
 		 336 aa  45.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2677  Integrase catalytic region  25.13 
 
 		 371 aa  45.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000537558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1497  Integrase catalytic region  25.13 
 
 		 355 aa  45.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  hitchhiker  0.000449962 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2714  Integrase catalytic region  25.13 
 
 		 362 aa  45.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal  0.786621 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3091  Integrase catalytic region  25.13 
 
 		 358 aa  45.8  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0808941 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0891  Integrase catalytic region  25.13 
 
 		 379 aa  45.8  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.233948  normal  0.0447709 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01931  probable transposase protein, Y4bF  34.07 
 
 		 494 aa  45.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1394  Integrase catalytic region  25.13 
 
 		 376 aa  45.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.295612  normal  0.0489416 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0088  Integrase catalytic region  25.13 
 
 		 364 aa  45.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>