More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0434 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3543  ISSod13, transposase  84.97 
 
 		 346 aa  639    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3880  ISSod13, transposase  84.97 
 
 		 346 aa  639    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0119  ISSod13, transposase  84.97 
 
 		 346 aa  639    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0142  ISSod13, transposase  84.97 
 
 		 346 aa  639    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0151  ISSod13, transposase  84.97 
 
 		 346 aa  639    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2463  Integrase catalytic region  100 
 
 		 346 aa  728    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0915  Integrase catalytic region  99.71 
 
 		 346 aa  725    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.277682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0434  Integrase catalytic region  100 
 
 		 346 aa  728    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2695  Integrase catalytic region  100 
 
 		 346 aa  728    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0101379  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3580  integrase catalytic subunit  83.82 
 
 		 346 aa  632  1e-180  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3940  integrase catalytic subunit  83.53 
 
 		 346 aa  632  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1763  integrase catalytic subunit  80.06 
 
 		 346 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2033  hypothetical protein  76.25 
 
 		 344 aa  566  1e-160  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1248  integrase catalytic subunit  70.09 
 
 		 347 aa  512  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113109  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1428  integrase catalytic subunit  70.09 
 
 		 347 aa  512  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1434  integrase catalytic subunit  70.09 
 
 		 347 aa  512  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2096  integrase catalytic subunit  70.09 
 
 		 347 aa  512  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.898918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2098  integrase catalytic subunit  70.09 
 
 		 347 aa  512  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2208  integrase catalytic subunit  70.09 
 
 		 347 aa  512  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3016  Integrase catalytic region  60.58 
 
 		 353 aa  457  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3516  Integrase catalytic region  60.87 
 
 		 350 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5962  Integrase catalytic region  60.58 
 
 		 350 aa  449  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0934  hypothetical protein  58.65 
 
 		 364 aa  442  1e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0345872 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0884  hypothetical protein  58.65 
 
 		 364 aa  442  1e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0956  hypothetical protein  58.65 
 
 		 364 aa  442  1e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1750  Integrase catalytic region  60.12 
 
 		 352 aa  434  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2426  Integrase catalytic region  60.12 
 
 		 352 aa  434  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0900  Integrase catalytic region  60.12 
 
 		 352 aa  434  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1678  Integrase catalytic region  60.12 
 
 		 352 aa  434  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2742  Integrase catalytic region  60.12 
 
 		 352 aa  434  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0453535  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1724  Integrase catalytic region  60.12 
 
 		 352 aa  434  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6430  Integrase catalytic region  60.6 
 
 		 345 aa  428  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5019  Integrase catalytic region  57.57 
 
 		 344 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679371  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0589  Integrase catalytic region  56.8 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.02075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0919  Integrase catalytic region  56.8 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.608605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1400  Integrase catalytic region  56.8 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000187237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1220  Integrase catalytic region  56.8 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1479  Integrase catalytic region  56.8 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1821  Integrase catalytic region  56.8 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.304505  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2889  Integrase catalytic region  56.8 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0567202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2551  Integrase catalytic region  56.8 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000856867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2553  Integrase catalytic region  56.8 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000502236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0338  Integrase catalytic region  56.8 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.465639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2676  Integrase catalytic region  56.8 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0409  Integrase catalytic region  56.8 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2972  Integrase catalytic region  56.8 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0804741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2977  Integrase catalytic region  56.8 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2685  Integrase catalytic region  56.8 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2690  Integrase catalytic region  56.8 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0586  Integrase catalytic region  56.8 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0674484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0823  Integrase catalytic region  56.8 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2693  Integrase catalytic region  56.8 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1838  Integrase catalytic region  56.8 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1850  Integrase catalytic region  56.8 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2708  Integrase catalytic region  56.8 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1832  Integrase catalytic region  56.8 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.394112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0220  Integrase catalytic region  56.8 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2961  Integrase catalytic region  56.8 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2149  Integrase catalytic region  56.51 
 
 		 348 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.142732  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4777  integrase catalytic region  67.8 
 
 		 210 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0852  integrase catalytic subunit  43.54 
 
 		 349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.336174  normal  0.0241758 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0877  integrase catalytic subunit  43.54 
 
 		 349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1005  Integrase catalytic region  43.13 
 
 		 349 aa  268  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0362  integrase, catalytic region  36.86 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.540687  hitchhiker  0.0000859615 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1864  integrase catalytic subunit  38.15 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2262  integrase catalytic subunit  38.15 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.512462  normal  0.657223 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3186  integrase catalytic subunit  38.15 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3191  integrase catalytic subunit  38.15 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3733  integrase catalytic subunit  38.15 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3878  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 		 344 aa  225  8e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4480  integrase, catalytic region  35.54 
 
 		 357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000214093 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00452  predicted DNA-binding transcriptional regulator  82.79 
 
 		 123 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3110  conserved hypothetical protein  82.79 
 
 		 123 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00457  hypothetical protein  82.79 
 
 		 123 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1966  ISSod13, transposase  40.23 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4665  integrase, catalytic region  55.56 
 
 		 155 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.599726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3895  iSSod13, transposase  80.33 
 
 		 63 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0553  putative transposase  51.95 
 
 		 107 aa  92.8  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0575438  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1113  hypothetical protein  62.5 
 
 		 67 aa  89.7  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00831584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01931  probable transposase protein, Y4bF  40.52 
 
 		 494 aa  89.4  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0627  integrase, catalytic region  55.38 
 
 		 95 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000721298  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2051  ChnZ  55.38 
 
 		 95 aa  86.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3007  hypothetical protein  31.61 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0552  hypothetical protein  58.33 
 
 		 86 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000200918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  26.15 
 
 		 481 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17960  integrase family protein  28.44 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  0.82846 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1510  integrase catalytic subunit  27.97 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  27.69 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  27.69 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  27.69 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  27.69 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  24.52 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  27.69 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  24.52 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  24.52 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4313  integrase catalytic subunit  27.91 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0419733  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  24.52 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0339  Integrase catalytic region  24.32 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0129  Integrase catalytic region  26.65 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1250  Integrase catalytic region  24.32 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>