70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1113 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1113  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  140  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00831584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1763  integrase catalytic subunit  90.62 
 
 		 346 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3580  integrase catalytic subunit  70.97 
 
 		 346 aa  94  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3940  integrase catalytic subunit  65.62 
 
 		 346 aa  92.8  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3543  ISSod13, transposase  65.62 
 
 		 346 aa  91.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3880  ISSod13, transposase  65.62 
 
 		 346 aa  91.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0119  ISSod13, transposase  65.62 
 
 		 346 aa  91.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0142  ISSod13, transposase  65.62 
 
 		 346 aa  91.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0151  ISSod13, transposase  65.62 
 
 		 346 aa  91.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3110  conserved hypothetical protein  62.5 
 
 		 123 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00452  predicted DNA-binding transcriptional regulator  62.5 
 
 		 123 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00457  hypothetical protein  62.5 
 
 		 123 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2695  Integrase catalytic region  62.5 
 
 		 346 aa  89.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0101379  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0434  Integrase catalytic region  62.5 
 
 		 346 aa  89.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0915  Integrase catalytic region  62.5 
 
 		 346 aa  89.4  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.277682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2463  Integrase catalytic region  62.5 
 
 		 346 aa  89.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2033  hypothetical protein  67.19 
 
 		 344 aa  87  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0956  hypothetical protein  61.29 
 
 		 364 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0934  hypothetical protein  61.29 
 
 		 364 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0345872 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0884  hypothetical protein  61.29 
 
 		 364 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5962  Integrase catalytic region  60.71 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3516  Integrase catalytic region  60.71 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2708  Integrase catalytic region  55.56 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1479  Integrase catalytic region  55.56 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1832  Integrase catalytic region  55.56 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.394112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1838  Integrase catalytic region  55.56 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1850  Integrase catalytic region  55.56 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2149  Integrase catalytic region  55.56 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.142732  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2551  Integrase catalytic region  55.56 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000856867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2553  Integrase catalytic region  55.56 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000502236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2676  Integrase catalytic region  55.56 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2685  Integrase catalytic region  55.56 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2690  Integrase catalytic region  55.56 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2693  Integrase catalytic region  55.56 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1821  Integrase catalytic region  55.56 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.304505  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2889  Integrase catalytic region  55.56 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0567202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2961  Integrase catalytic region  55.56 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2972  Integrase catalytic region  55.56 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0804741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2977  Integrase catalytic region  55.56 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2208  integrase catalytic subunit  56.45 
 
 		 347 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2098  integrase catalytic subunit  56.45 
 
 		 347 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2096  integrase catalytic subunit  56.45 
 
 		 347 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.898918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1434  integrase catalytic subunit  56.45 
 
 		 347 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1428  integrase catalytic subunit  56.45 
 
 		 347 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1248  integrase catalytic subunit  56.45 
 
 		 347 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113109  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1400  Integrase catalytic region  55.56 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000187237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0220  Integrase catalytic region  55.56 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0338  Integrase catalytic region  55.56 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.465639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0409  Integrase catalytic region  55.56 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0586  Integrase catalytic region  55.56 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0674484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0589  Integrase catalytic region  55.56 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.02075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0823  Integrase catalytic region  55.56 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0919  Integrase catalytic region  55.56 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.608605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1220  Integrase catalytic region  55.56 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3016  Integrase catalytic region  48.39 
 
 		 353 aa  63.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2742  Integrase catalytic region  53.23 
 
 		 352 aa  61.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0453535  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2426  Integrase catalytic region  53.23 
 
 		 352 aa  61.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1750  Integrase catalytic region  53.23 
 
 		 352 aa  61.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1724  Integrase catalytic region  53.23 
 
 		 352 aa  61.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1678  Integrase catalytic region  53.23 
 
 		 352 aa  61.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0900  Integrase catalytic region  53.23 
 
 		 352 aa  61.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6430  Integrase catalytic region  52.73 
 
 		 345 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4480  integrase, catalytic region  41.27 
 
 		 357 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000214093 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3878  integrase catalytic subunit  41.27 
 
 		 344 aa  53.5  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4665  integrase, catalytic region  67.65 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.599726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0852  integrase catalytic subunit  41.18 
 
 		 349 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.336174  normal  0.0241758 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0877  integrase catalytic subunit  41.18 
 
 		 349 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1005  Integrase catalytic region  41.18 
 
 		 349 aa  50.1  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0362  integrase, catalytic region  40.68 
 
 		 337 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.540687  hitchhiker  0.0000859615 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5019  Integrase catalytic region  38.71 
 
 		 344 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>