More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4313 on replicon NC_008538
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008538  Arth_4313  integrase catalytic subunit  100 
 
 
309 aa  630  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0419733  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1510  integrase catalytic subunit  99.67 
 
 
325 aa  623  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1813  Integrase catalytic region  61.64 
 
 
332 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1107  Integrase catalytic region  61.64 
 
 
332 aa  374  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.528266 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1272  integrase catalytic subunit  57.14 
 
 
329 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1255  integrase catalytic subunit  57.14 
 
 
329 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2416  integrase catalytic subunit  57.14 
 
 
329 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571149  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4349  transposase  59.24 
 
 
329 aa  332  4e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  53.31 
 
 
481 aa  308  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1652  integrase catalytic subunit  51.24 
 
 
358 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1137  integrase catalytic subunit  51.24 
 
 
358 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1068  integrase catalytic subunit  51.24 
 
 
358 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1052  integrase catalytic subunit  51.24 
 
 
358 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1120  integrase catalytic subunit  51.24 
 
 
358 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4847  Integrase catalytic region  51.74 
 
 
328 aa  295  8e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24520  integrase family protein  52.37 
 
 
328 aa  293  2e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22790  integrase family protein  50.83 
 
 
318 aa  285  8e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.582156  normal  0.782085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  49.2 
 
 
347 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  48.87 
 
 
330 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  48.87 
 
 
330 aa  249  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  48.87 
 
 
330 aa  249  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  48.87 
 
 
330 aa  249  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1036  Integrase catalytic region  46.51 
 
 
318 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1133  Integrase catalytic region  46.51 
 
 
318 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0287  Integrase catalytic region  46.51 
 
 
318 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21500  transposase  46.03 
 
 
335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05300  transposase  45.4 
 
 
335 aa  231  1e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1534  integrase catalytic subunit  46.45 
 
 
341 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14260  transposase  44.76 
 
 
335 aa  229  4e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00196593  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1511  integrase catalytic subunit  46.45 
 
 
341 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2591  integrase catalytic subunit  46.73 
 
 
333 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4011  integrase catalytic subunit  46.73 
 
 
333 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141418  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3937  integrase catalytic subunit  46.73 
 
 
333 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2546  integrase catalytic subunit  46.73 
 
 
333 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303835  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3720  integrase catalytic subunit  46.73 
 
 
333 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158828  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3793  integrase catalytic subunit  46.41 
 
 
321 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338369  normal  0.128891 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17960  integrase family protein  52.86 
 
 
422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  0.82846 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03170  transposase  46.85 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0513  ISBm3, transposase, programmed frameshift  42.05 
 
 
313 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  41.39 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  41.39 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  41.39 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  41.39 
 
 
314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  41.39 
 
 
314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  42.72 
 
 
316 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  43.05 
 
 
316 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  43.05 
 
 
316 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  42.72 
 
 
316 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  42.72 
 
 
316 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1334  Integrase catalytic region  43.57 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.661987  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23770  integrase family protein  43.22 
 
 
334 aa  196  6e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0797  Integrase catalytic region  42.01 
 
 
335 aa  195  8.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  42.05 
 
 
316 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1610  Integrase catalytic region  42.77 
 
 
335 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3273  Integrase catalytic region  42.63 
 
 
335 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11870  transposase  41.53 
 
 
365 aa  194  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3283  Integrase catalytic region  40.99 
 
 
351 aa  192  7e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3687  Integrase catalytic region  40.99 
 
 
351 aa  192  7e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3352  integrase catalytic subunit  39.8 
 
 
315 aa  192  9e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3424  integrase catalytic subunit  39.8 
 
 
315 aa  192  9e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.821983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3207  integrase catalytic subunit  39.8 
 
 
315 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249137  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2560  integrase catalytic subunit  39.8 
 
 
315 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278482  decreased coverage  0.00231503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4445  integrase catalytic subunit  39.8 
 
 
315 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.730618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3394  integrase catalytic subunit  39.8 
 
 
315 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2137  integrase catalytic subunit  39.8 
 
 
315 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2979  integrase catalytic subunit  39.8 
 
 
315 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161528  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3658  integrase catalytic subunit  39.8 
 
 
315 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0179  integrase catalytic subunit  39.8 
 
 
315 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4598  integrase catalytic subunit  39.8 
 
 
315 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4504  integrase catalytic subunit  39.8 
 
 
315 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.23514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4025  integrase catalytic subunit  39.8 
 
 
315 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1990  integrase catalytic subunit  39.8 
 
 
315 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1870  integrase catalytic subunit  39.8 
 
 
315 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0673  integrase catalytic subunit  39.8 
 
 
315 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.946577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2654  integrase catalytic subunit  39.8 
 
 
315 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  0.067102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0485  integrase catalytic subunit  39.8 
 
 
315 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0549  integrase catalytic subunit  39.8 
 
 
315 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0754  integrase catalytic subunit  39.4 
 
 
315 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18440  hypothetical protein  49.22 
 
 
316 aa  115  8.999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0765744  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0489  transposase  38.19 
 
 
195 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11320  Integrase, catalytic domain-containing protein  28.66 
 
 
381 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  28.66 
 
 
381 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  28.66 
 
 
381 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50600  transposase  28.66 
 
 
381 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33550  transposase  28.66 
 
 
381 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09100  Integrase, catalytic domain-containing protein  28.66 
 
 
381 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.387294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15790  Integrase, catalytic domain-containing protein  28.66 
 
 
381 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1303  Integrase catalytic region  28.43 
 
 
378 aa  97.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1705  Integrase catalytic region  28.43 
 
 
378 aa  97.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0433  Integrase catalytic region  28.43 
 
 
378 aa  97.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.705419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1219  Integrase catalytic region  28.43 
 
 
378 aa  97.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1250  Integrase catalytic region  28.43 
 
 
378 aa  97.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1220  Integrase catalytic region  28.43 
 
 
378 aa  97.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1347  Integrase catalytic region  28.43 
 
 
378 aa  97.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.519975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3192  Integrase catalytic region  28.43 
 
 
378 aa  97.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00354129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0339  Integrase catalytic region  28.43 
 
 
378 aa  97.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3338  Integrase catalytic region  29.58 
 
 
380 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858997  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0877  integrase catalytic subunit  32.65 
 
 
349 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120135  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0852  integrase catalytic subunit  32.65 
 
 
349 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.336174  normal  0.0241758 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4342  Integrase catalytic region  29.84 
 
 
389 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>