37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1595 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  99.11 
 
 		 1524 bp  1709    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  99.11 
 
 		 1524 bp  1709    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1723    99.13 
 
 		 2793 bp  1750    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.629246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1595    100 
 
 		 2911 bp  5771    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.614383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  99.11 
 
 		 1524 bp  1709    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1467 bp  1772    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  99.11 
 
 		 1524 bp  1709    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3235  integrase catalytic subunit  81.87 
 
 		 1527 bp  176  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3165    82.33 
 
 		 878 bp  135  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6462    89.61 
 
 		 2257 bp  89.7  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.852061 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0483  integrase catalytic subunit  82.79 
 
 		 1527 bp  75.8  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1042  Integrase catalytic region  81.51 
 
 		 1527 bp  75.8  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861303  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3365  integrase catalytic subunit  82.79 
 
 		 1527 bp  75.8  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  84.31 
 
 		 1530 bp  75.8  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  84.31 
 
 		 1530 bp  75.8  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4688  Integrase catalytic region  80.82 
 
 		 1527 bp  67.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5726  hypothetical protein  97.37 
 
 		 399 bp  67.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11779    90.38 
 
 		 2165 bp  63.9  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.29759e-44  hitchhiker  0.00000000259187 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11805    90.38 
 
 		 2663 bp  63.9  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000082739  normal  0.0295983 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1664  hypothetical protein  100 
 
 		 405 bp  60  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2818    91.11 
 
 		 2774 bp  58  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0155  transposase IstA for insertion sequence IS1326  83.53 
 
 		 1524 bp  58  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.791462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2556  integrase catalytic subunit  82.61 
 
 		 1506 bp  56  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3403  IS21 family transposase  85.29 
 
 		 1518 bp  56  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3044  IS21 family transposase  85.29 
 
 		 1518 bp  56  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1639  IS21 family transposase  85.29 
 
 		 1518 bp  56  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0683  IS21 family transposase  85.29 
 
 		 1518 bp  56  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2899  integrase catalytic subunit  82.61 
 
 		 1506 bp  56  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4866  integrase catalytic subunit  82.61 
 
 		 1506 bp  56  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4956  integrase catalytic subunit  82.61 
 
 		 1506 bp  56  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0004  integrase catalytic subunit  82.61 
 
 		 1506 bp  56  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3204  integrase catalytic subunit  82.61 
 
 		 1506 bp  56  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3299  integrase catalytic subunit  82.61 
 
 		 1506 bp  56  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4641  UbiE/COQ5 methyltransferase  90.48 
 
 		 891 bp  52  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3451    86.89 
 
 		 388 bp  50.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1107    93.94 
 
 		 1499 bp  50.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4951    90.24 
 
 		 3573 bp  50.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>