18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6462 on replicon NC_010518
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010518  Mrad2831_6462    100 
 
 
2257 bp  4474    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.852061 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1595    89.61 
 
 
2911 bp  89.7  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.614383  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2818    86.81 
 
 
2774 bp  85.7  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3517  DNA-directed DNA polymerase  86.52 
 
 
1437 bp  81.8  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6255  DNA-directed DNA polymerase  88.89 
 
 
1329 bp  79.8  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.983679 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01161  transposase  94.12 
 
 
648 bp  77.8  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4107  hypothetical protein  87.84 
 
 
765 bp  75.8  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.408855  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3536  DNA-repair protein  95.56 
 
 
1257 bp  73.8  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3890    92.16 
 
 
919 bp  69.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4951    90.74 
 
 
3573 bp  67.9  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3940    88.71 
 
 
1295 bp  67.9  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0558    100 
 
 
285 bp  63.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2997    100 
 
 
210 bp  61.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5726  hypothetical protein  88.89 
 
 
399 bp  60  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0337    96.97 
 
 
1242 bp  58  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0315  DNA-directed DNA polymerase  96.97 
 
 
1332 bp  58  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.639091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1354    96.97 
 
 
1179 bp  58  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221466 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0175  DNA-directed DNA polymerase  86.44 
 
 
1272 bp  54  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>