31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3940 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7046  UMUC domain protein DNA-repair protein  86.22 
 
 		 1329 bp  841    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3940    100 
 
 		 1295 bp  2567    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4994  hypothetical protein  87.96 
 
 		 642 bp  385  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6837  hypothetical protein  91.01 
 
 		 465 bp  345  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0555  DNA-directed DNA polymerase  87.89 
 
 		 285 bp  220  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104449  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2997    88.94 
 
 		 210 bp  214  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0558    87.68 
 
 		 285 bp  212  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6255  DNA-directed DNA polymerase  80.6 
 
 		 1329 bp  176  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.983679 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5028  hypothetical protein  85.12 
 
 		 360 bp  172  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3952    87.19 
 
 		 330 bp  172  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3928  hypothetical protein  85.12 
 
 		 360 bp  172  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1354    79.71 
 
 		 1179 bp  155  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0315  DNA-directed DNA polymerase  85.28 
 
 		 1332 bp  133  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.639091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0337    78.55 
 
 		 1242 bp  119  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7650  hypothetical protein  90.32 
 
 		 282 bp  113  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3517  DNA-directed DNA polymerase  78.04 
 
 		 1437 bp  99.6  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0339  hypothetical protein  83.78 
 
 		 207 bp  77.8  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0052  DNA-directed DNA polymerase  90.48 
 
 		 1350 bp  77.8  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154189 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8751    79.13 
 
 		 246 bp  67.9  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.779041  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6462    88.71 
 
 		 2257 bp  67.9  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.852061 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3536  DNA-repair protein  88.71 
 
 		 1257 bp  67.9  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1356    82.69 
 
 		 108 bp  63.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0329005 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1279  DNA-directed DNA polymerase  91.49 
 
 		 1272 bp  61.9  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6187    90.2 
 
 		 249 bp  61.9  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0591  impB/mucB/samB family protein  89.09 
 
 		 1101 bp  61.9  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110123  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4498  DNA-directed DNA polymerase  91.11 
 
 		 1281 bp  58  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2761  DNA-directed DNA polymerase  89.36 
 
 		 1281 bp  54  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0282343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4997  peptidase S24 and S26 domain protein  85.48 
 
 		 516 bp  52  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10854  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4268  DNA-repair protein  100 
 
 		 1149 bp  52  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0006    96.67 
 
 		 1014 bp  52  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1982  DNA-directed DNA polymerase  91.67 
 
 		 1272 bp  48.1  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84718  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>