16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2997 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2997    100 
 
 		 210 bp  416  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0558    94.71 
 
 		 285 bp  295  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3940    88.94 
 
 		 1295 bp  214  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6255  DNA-directed DNA polymerase  86.18 
 
 		 1329 bp  119  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.983679 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7046  UMUC domain protein DNA-repair protein  86.49 
 
 		 1329 bp  101  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0315  DNA-directed DNA polymerase  89.29 
 
 		 1332 bp  95.6  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.639091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3517  DNA-directed DNA polymerase  90.57 
 
 		 1437 bp  65.9  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6462    100 
 
 		 2257 bp  61.9  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.852061 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3536  DNA-repair protein  100 
 
 		 1257 bp  60  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0337    88.68 
 
 		 1242 bp  58  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0459  DNA-directed DNA polymerase  94.29 
 
 		 1272 bp  54  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204967  normal  0.799613 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1354    96.77 
 
 		 1179 bp  54  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221466 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1279  DNA-directed DNA polymerase  96.55 
 
 		 1272 bp  50.1  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1550  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 1257 bp  48.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0477659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0339  hypothetical protein  93.55 
 
 		 207 bp  46.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0175  DNA-directed DNA polymerase  91.43 
 
 		 1272 bp  46.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>