15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0558 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0558    100 
 
 		 285 bp  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2997    94.71 
 
 		 210 bp  295  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3940    87.68 
 
 		 1295 bp  212  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7046  UMUC domain protein DNA-repair protein  93.1 
 
 		 1329 bp  167  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0315  DNA-directed DNA polymerase  84.24 
 
 		 1332 bp  135  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.639091 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6255  DNA-directed DNA polymerase  83.78 
 
 		 1329 bp  129  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.983679 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0559  peptidase S24 and S26 domain protein  100 
 
 		 516 bp  123  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0339  hypothetical protein  84.82 
 
 		 207 bp  87.7  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3517  DNA-directed DNA polymerase  94.34 
 
 		 1437 bp  81.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0337    92.45 
 
 		 1242 bp  73.8  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3536  DNA-repair protein  97.3 
 
 		 1257 bp  65.9  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1354    90.57 
 
 		 1179 bp  65.9  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4997  peptidase S24 and S26 domain protein  88.52 
 
 		 516 bp  65.9  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10854  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6462    100 
 
 		 2257 bp  63.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.852061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1356    82.61 
 
 		 108 bp  56  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0329005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>