33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1354 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0315  DNA-directed DNA polymerase  91.7 
 
 		 1332 bp  1499    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.639091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1354    100 
 
 		 1179 bp  2337    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221466 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3517  DNA-directed DNA polymerase  89.23 
 
 		 1437 bp  1253    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0337    91.77 
 
 		 1242 bp  1534    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6255  DNA-directed DNA polymerase  82.71 
 
 		 1329 bp  529  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.983679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0362  DNA-directed DNA polymerase  87.96 
 
 		 384 bp  392  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7046  UMUC domain protein DNA-repair protein  82.28 
 
 		 1329 bp  218  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1564    85.49 
 
 		 228 bp  161  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3940    79.71 
 
 		 1295 bp  155  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4994  hypothetical protein  90.24 
 
 		 642 bp  99.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0052  DNA-directed DNA polymerase  90.67 
 
 		 1350 bp  93.7  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3952    88.46 
 
 		 330 bp  83.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6187    84.03 
 
 		 249 bp  81.8  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8751    84.03 
 
 		 246 bp  81.8  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.779041  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1279  DNA-directed DNA polymerase  95.83 
 
 		 1272 bp  79.8  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5365    83.19 
 
 		 213 bp  77.8  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6837  hypothetical protein  83.62 
 
 		 465 bp  75.8  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3536  DNA-repair protein  92.59 
 
 		 1257 bp  75.8  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4880  hypothetical protein  82.31 
 
 		 537 bp  71.9  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1751  umuC protein  95.24 
 
 		 1284 bp  67.9  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0555  DNA-directed DNA polymerase  81.12 
 
 		 285 bp  65.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104449  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0558    90.57 
 
 		 285 bp  65.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0175  DNA-directed DNA polymerase  84.42 
 
 		 1272 bp  58  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6462    96.97 
 
 		 2257 bp  58  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.852061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3928  hypothetical protein  87.5 
 
 		 360 bp  56  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5028  hypothetical protein  87.5 
 
 		 360 bp  56  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2997    96.77 
 
 		 210 bp  54  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3752  DNA-directed DNA polymerase  84.51 
 
 		 1263 bp  54  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2378  DNA-directed DNA polymerase  90.48 
 
 		 1278 bp  52  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7650  hypothetical protein  90.24 
 
 		 282 bp  50.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0100    91.67 
 
 		 198 bp  48.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0496  Hpt protein  93.75 
 
 		 351 bp  48.1  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0591  impB/mucB/samB family protein  90 
 
 		 1101 bp  48.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>