31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0337 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3517  DNA-directed DNA polymerase  88.46 
 
 		 1437 bp  1178    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0315  DNA-directed DNA polymerase  89.63 
 
 		 1332 bp  1332    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.639091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0337    100 
 
 		 1242 bp  2462    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1354    91.77 
 
 		 1179 bp  1534    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221466 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6255  DNA-directed DNA polymerase  81.81 
 
 		 1329 bp  456  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.983679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0362  DNA-directed DNA polymerase  85.56 
 
 		 384 bp  313  6.999999999999999e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7046  UMUC domain protein DNA-repair protein  80 
 
 		 1329 bp  155  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1564    88.6 
 
 		 228 bp  123  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3940    78.55 
 
 		 1295 bp  119  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4994  hypothetical protein  88.61 
 
 		 642 bp  85.7  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0052  DNA-directed DNA polymerase  89.19 
 
 		 1350 bp  83.8  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3952    88.46 
 
 		 330 bp  83.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1279  DNA-directed DNA polymerase  95.83 
 
 		 1272 bp  79.8  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0558    92.45 
 
 		 285 bp  73.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5365    82.35 
 
 		 213 bp  69.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3536  DNA-repair protein  95.24 
 
 		 1257 bp  67.9  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6837  hypothetical protein  82.35 
 
 		 465 bp  65.9  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8751    97.3 
 
 		 246 bp  65.9  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.779041  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4880  hypothetical protein  89.47 
 
 		 537 bp  65.9  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0555  DNA-directed DNA polymerase  80.82 
 
 		 285 bp  63.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104449  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6187    82.14 
 
 		 249 bp  60  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2997    88.68 
 
 		 210 bp  58  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6462    96.97 
 
 		 2257 bp  58  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.852061 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2378  DNA-directed DNA polymerase  88.46 
 
 		 1278 bp  56  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5028  hypothetical protein  87.5 
 
 		 360 bp  56  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3928  hypothetical protein  87.5 
 
 		 360 bp  56  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1751  umuC protein  96.88 
 
 		 1284 bp  56  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7650  hypothetical protein  100 
 
 		 282 bp  54  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3752  DNA-directed DNA polymerase  88 
 
 		 1263 bp  52  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0100    91.89 
 
 		 198 bp  50.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01659  oxidoreductase protein  93.75 
 
 		 867 bp  48.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>