27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7650 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7650  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  186  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6837  hypothetical protein  82 
 
 		 154 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3517  DNA-directed DNA polymerase  73.58 
 
 		 478 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6255  DNA-directed DNA polymerase  80.85 
 
 		 442 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.983679 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7046  UMUC domain protein DNA-repair protein  77.08 
 
 		 442 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0315  DNA-directed DNA polymerase  69.81 
 
 		 443 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.639091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4994  hypothetical protein  75 
 
 		 213 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0555  DNA-directed DNA polymerase  74.47 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104449  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5028  hypothetical protein  72.92 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3928  hypothetical protein  72.92 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  75 
 
 		 666 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0362  DNA-directed DNA polymerase  60.38 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3752  DNA-directed DNA polymerase  64.44 
 
 		 420 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  55.1 
 
 		 672 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4880  hypothetical protein  59.57 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4645  Cellulose synthase (UDP-forming)  52.94 
 
 		 664 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  55.1 
 
 		 672 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  56.82 
 
 		 664 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  55.1 
 
 		 672 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0220  DNA-directed DNA polymerase  53.49 
 
 		 436 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4341  DNA-directed DNA polymerase  54.35 
 
 		 432 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0705  DNA-directed DNA polymerase  50 
 
 		 450 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3841  DNA-directed DNA polymerase  48.84 
 
 		 437 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4983  UMUC-like DNA-repair protein  45.65 
 
 		 432 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000315583 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4321  DNA-directed DNA polymerase  46.51 
 
 		 428 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.466657 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0052  DNA-directed DNA polymerase  35.63 
 
 		 449 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154189 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2973  DNA-directed DNA polymerase  51.06 
 
 		 492 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0296388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>