25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4880 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4880  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  360  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3832  hypothetical protein  70 
 
 		 103 aa  141  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0304  hypothetical protein  77 
 
 		 187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1578  hypothetical protein  75 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.942269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4382  hypothetical protein  76 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60628 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3758  hypothetical protein  65.35 
 
 		 188 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0157129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3549  hypothetical protein  61.73 
 
 		 81 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0315  DNA-directed DNA polymerase  75.44 
 
 		 443 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.639091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3517  DNA-directed DNA polymerase  68.42 
 
 		 478 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0362  DNA-directed DNA polymerase  61.4 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6837  hypothetical protein  51.22 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5028  hypothetical protein  61.4 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3928  hypothetical protein  61.4 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7046  UMUC domain protein DNA-repair protein  60.71 
 
 		 442 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6255  DNA-directed DNA polymerase  60.71 
 
 		 442 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.983679 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4994  hypothetical protein  60.38 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0555  DNA-directed DNA polymerase  58.93 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104449  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4984  hypothetical protein  43.04 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1415  hypothetical protein  40 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  0.264539 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1689  hypothetical protein  40 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.198075  normal  0.504113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4114  hypothetical protein  39.51 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.649728  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7650  hypothetical protein  59.57 
 
 		 93 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3752  DNA-directed DNA polymerase  47.27 
 
 		 420 aa  52.8  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4983  UMUC-like DNA-repair protein  40.26 
 
 		 432 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000315583 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4341  DNA-directed DNA polymerase  38.67 
 
 		 432 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>