66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6213 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6213    100 
 
 		 2705 bp  5362    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  82.16 
 
 		 1200 bp  440  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  82.16 
 
 		 1200 bp  440  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  80.46 
 
 		 1200 bp  276  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  80.46 
 
 		 1200 bp  276  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  80.46 
 
 		 1200 bp  270  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1860  transposase mutator type  80.46 
 
 		 801 bp  270  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.363503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  80.15 
 
 		 1200 bp  254  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  80.15 
 
 		 1200 bp  254  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1065    83.52 
 
 		 1039 bp  240  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  79.97 
 
 		 1200 bp  226  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4295    89.64 
 
 		 431 bp  224  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1377    89.57 
 
 		 416 bp  218  5.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.552993  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6345  transposase mutator type  81.65 
 
 		 558 bp  214  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442764  normal  0.442259 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0009  transposase  79.81 
 
 		 927 bp  188  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0014  transposase  79.81 
 
 		 927 bp  188  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3047    81.52 
 
 		 1184 bp  174  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2516  transposase mutator type  80.54 
 
 		 444 bp  172  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  80.56 
 
 		 1200 bp  151  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  80.56 
 
 		 1200 bp  151  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0475    81.48 
 
 		 715 bp  119  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.920505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2280    86.07 
 
 		 694 bp  107  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1880    81.34 
 
 		 723 bp  105  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5006  transposase mutator type  78.62 
 
 		 1014 bp  101  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570221  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2922    85.5 
 
 		 399 bp  101  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4163    87.16 
 
 		 306 bp  89.7  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1438    83.46 
 
 		 457 bp  89.7  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0008  putative fragment of transposase protein  92.19 
 
 		 252 bp  87.7  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0015  putative fragment of transposase protein  92.19 
 
 		 252 bp  87.7  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0395238  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1952    90.79 
 
 		 2579 bp  87.7  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5467    85.11 
 
 		 262 bp  75.8  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00460938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3616  transposase  83.64 
 
 		 288 bp  75.8  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3245    83.84 
 
 		 2780 bp  69.9  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.884067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0170  transposase IS256  83.84 
 
 		 1197 bp  69.9  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452529  hitchhiker  0.00578172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0899    83.84 
 
 		 2433 bp  69.9  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.811127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1760  transposase IS256  83.84 
 
 		 1197 bp  69.9  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.534749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2225  transposase IS256  83.84 
 
 		 1197 bp  69.9  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.902645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2744  transposase IS256  83.84 
 
 		 1197 bp  69.9  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169837  normal  0.196457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3246  transposase IS256  83.84 
 
 		 1197 bp  69.9  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1687  transposase, mutator type  87.14 
 
 		 1248 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0836  transposase, mutator type  87.14 
 
 		 1248 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.976413  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1035  transposase, mutator type  87.14 
 
 		 1248 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000123113  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1419  transposase, mutator type  87.14 
 
 		 1248 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1465  transposase, mutator type  87.14 
 
 		 1248 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1678  transposase, mutator type  87.14 
 
 		 1248 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4846  transposase, mutator type  87.14 
 
 		 1248 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0431  transposase, mutator type  87.14 
 
 		 1248 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.668856  normal  0.200495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0823  transposase, mutator type  87.14 
 
 		 1248 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0949  transposase, mutator type  87.14 
 
 		 1248 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1437  transposase, mutator type  87.14 
 
 		 1248 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.515564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1488  transposase, mutator type  87.14 
 
 		 1248 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1707  transposase, mutator type  87.14 
 
 		 189 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181873  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4917  transposase, mutator type  87.14 
 
 		 1248 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4934  transposase, mutator type  87.14 
 
 		 1248 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3267  transposase, mutator type  86.49 
 
 		 1248 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5858  transposase, mutator type  87.14 
 
 		 1248 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000919553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5814  transposase, mutator type  87.14 
 
 		 1248 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242706  hitchhiker  0.000216578 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5730  transposase, mutator type  87.14 
 
 		 1248 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5729  transposase, mutator type  87.14 
 
 		 1248 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5364  transposase, mutator type  87.14 
 
 		 1248 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0039  transposase, mutator type  87.14 
 
 		 1248 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290082 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4911  transposase, mutator type  86.3 
 
 		 1212 bp  65.9  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.462522 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1374  transposase, mutator type  78.11 
 
 		 1197 bp  58  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3134    91.11 
 
 		 214 bp  58  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0102047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1925    85.71 
 
 		 596 bp  54  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2565    80.91 
 
 		 228 bp  52  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>