166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_B0008 on replicon NC_007641
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007641  Rru_B0008  putative fragment of transposase protein  100 
 
 		 83 aa  166  9e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0015  putative fragment of transposase protein  100 
 
 		 83 aa  166  9e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0395238  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  79.27 
 
 		 399 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  79.27 
 
 		 399 aa  130  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  79.27 
 
 		 399 aa  130  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  79.27 
 
 		 399 aa  130  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  79.27 
 
 		 399 aa  130  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  79.27 
 
 		 399 aa  130  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1860  transposase mutator type  78.05 
 
 		 266 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.363503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  76.83 
 
 		 399 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  76.83 
 
 		 399 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  74.39 
 
 		 399 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  74.39 
 
 		 399 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5006  transposase mutator type  73.17 
 
 		 337 aa  122  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570221  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6345  transposase mutator type  74.39 
 
 		 185 aa  122  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442764  normal  0.442259 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2516  transposase mutator type  75.31 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2904  transposase  72.22 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2225  transposase IS256  54.88 
 
 		 398 aa  91.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.902645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1760  transposase IS256  54.88 
 
 		 398 aa  91.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.534749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0170  transposase IS256  54.88 
 
 		 398 aa  92  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452529  hitchhiker  0.00578172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3246  transposase IS256  54.88 
 
 		 398 aa  91.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2744  transposase IS256  54.88 
 
 		 398 aa  91.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169837  normal  0.196457 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1374  transposase, mutator type  53.66 
 
 		 398 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1182  transposase mutator type  46.25 
 
 		 415 aa  77  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1234  transposase mutator type  46.25 
 
 		 415 aa  77  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.199668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2883  transposase mutator type  46.25 
 
 		 414 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000527688  hitchhiker  0.001163 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2131  hypothetical protein  60.34 
 
 		 83 aa  71.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0296794  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3569  transposase, mutator type  45.12 
 
 		 402 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3612  transposase, mutator type  45.12 
 
 		 402 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0390226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2108  transposase, mutator type  45.12 
 
 		 402 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.50702  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3032  transposase mutator type  48.53 
 
 		 413 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4611  transposase mutator type  48.53 
 
 		 413 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.310217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1368  transposase mutator type  48.53 
 
 		 540 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3172  transposase, mutator type  43.9 
 
 		 402 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15251  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3185  transposase, mutator type  43.9 
 
 		 402 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0504215  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3219  transposase, mutator type  43.9 
 
 		 402 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0790  transposase, mutator type  43.9 
 
 		 402 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0798  transposase, mutator type  43.9 
 
 		 402 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0700  transposase, mutator type  47.06 
 
 		 428 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0889  transposase, mutator type  47.06 
 
 		 428 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2876  transposase, mutator type  47.06 
 
 		 428 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0454  transposase, mutator type  45.59 
 
 		 353 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0688  transposase, mutator type  45.59 
 
 		 411 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3126  transposase, mutator type  42.68 
 
 		 402 aa  63.5  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601222  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4171  transposase mutator type  43.9 
 
 		 384 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3590  transposase, mutator type  45.59 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7079  transposase mutator type  44.12 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8623  transposase mutator type  44.12 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  0.594548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0221  transposase mutator type  44.12 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5496  transposase, mutator type  46.88 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512335 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4911  transposase, mutator type  42.68 
 
 		 403 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.462522 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13135  transposase  39.33 
 
 		 436 aa  62  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.15098 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5356  transposase, mutator type  42.65 
 
 		 428 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11065  transposase  46.27 
 
 		 415 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.540843 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11223  transposase  46.27 
 
 		 415 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000146016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12534  transposase  46.27 
 
 		 415 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.922715  decreased coverage  0.00121453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12681  hypothetical protein  46.27 
 
 		 267 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.001544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13039  transposase  46.27 
 
 		 415 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7584e-95  decreased coverage  0.000658378 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4069  transposase mutator type  40.24 
 
 		 402 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4031  transposase mutator type  40.24 
 
 		 402 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3966  transposase mutator type  40.24 
 
 		 402 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5067  transposase mutator type  40.24 
 
 		 402 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4226  transposase mutator type  40.24 
 
 		 402 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4182  transposase mutator type  40.24 
 
 		 402 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5445  transposase mutator type  40.24 
 
 		 402 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0157  transposase mutator type  40.24 
 
 		 402 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0266  transposase mutator type  40.24 
 
 		 402 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.598198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0343  transposase mutator type  40.24 
 
 		 402 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0944  transposase mutator type  40.24 
 
 		 402 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2394  transposase mutator type  40.24 
 
 		 402 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3714  transposase mutator type  40.24 
 
 		 402 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3779  transposase mutator type  40.24 
 
 		 402 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688566  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5557  transposase mutator type  40.24 
 
 		 402 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.032396 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1513  transposase mutator type  43.75 
 
 		 405 aa  57  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.688883  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1904  transposase mutator type  43.75 
 
 		 405 aa  57  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1539  transposase mutator type  43.75 
 
 		 405 aa  57  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3132  transposase mutator type  43.75 
 
 		 405 aa  57  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0112  transposase mutator type  43.75 
 
 		 405 aa  57  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1531  transposase mutator type  43.75 
 
 		 405 aa  57  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1511  transposase mutator type  43.75 
 
 		 405 aa  57  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.647595  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00420  transposase, mutator family  35.8 
 
 		 417 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00300  transposase, mutator family  35.8 
 
 		 417 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00410  transposase, mutator family  35.8 
 
 		 417 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12170  transposase, mutator family  35.8 
 
 		 417 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17950  transposase  34.57 
 
 		 416 aa  52.8  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.776929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03110  transposase, mutator family  35.8 
 
 		 417 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.529932  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20590  transposase, mutator family  35.44 
 
 		 417 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25910  transposase  34.57 
 
 		 416 aa  53.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25830  transposase  34.57 
 
 		 416 aa  52.8  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05430  transposase  34.57 
 
 		 416 aa  52.8  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02160  transposase, mutator family  35.44 
 
 		 417 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12080  transposase, mutator family  35.8 
 
 		 417 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0258594  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1678  transposase, mutator type  34.57 
 
 		 415 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4846  transposase, mutator type  34.57 
 
 		 415 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5364  transposase, mutator type  34.57 
 
 		 415 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5729  transposase, mutator type  34.57 
 
 		 415 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5730  transposase, mutator type  34.57 
 
 		 415 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5814  transposase, mutator type  34.57 
 
 		 415 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242706  hitchhiker  0.000216578 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5858  transposase, mutator type  34.57 
 
 		 415 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000919553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4934  transposase, mutator type  34.57 
 
 		 415 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166012  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>