70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2280 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3047    88.69 
 
 		 1184 bp  704    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  89.32 
 
 		 1200 bp  781    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  89.32 
 
 		 1200 bp  781    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2128  transposase, mutator type  99.57 
 
 		 468 bp  912    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.449064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1065    87.31 
 
 		 1039 bp  640    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2280    100 
 
 		 694 bp  1376    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2922    85.64 
 
 		 399 bp  329  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1880    81.33 
 
 		 723 bp  311  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  80.97 
 
 		 1200 bp  307  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  80.66 
 
 		 1200 bp  291  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  80.66 
 
 		 1200 bp  291  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  80 
 
 		 1200 bp  258  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  79.88 
 
 		 1200 bp  236  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  79.88 
 
 		 1200 bp  236  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0014  transposase  79.54 
 
 		 927 bp  202  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0009  transposase  79.54 
 
 		 927 bp  202  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  78.82 
 
 		 1200 bp  194  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  78.82 
 
 		 1200 bp  194  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5006  transposase mutator type  86.14 
 
 		 1014 bp  147  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570221  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5004    81.85 
 
 		 477 bp  141  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0511261  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1860  transposase mutator type  80.95 
 
 		 801 bp  119  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.363503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2565    83.63 
 
 		 228 bp  111  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6213    86.07 
 
 		 2705 bp  107  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3616  transposase  82.93 
 
 		 288 bp  97.6  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0475    82.5 
 
 		 715 bp  89.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.920505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3134    83.23 
 
 		 214 bp  89.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0102047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2775    95.92 
 
 		 319 bp  81.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0170  transposase IS256  83.16 
 
 		 1197 bp  61.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452529  hitchhiker  0.00578172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1760  transposase IS256  83.16 
 
 		 1197 bp  61.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.534749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2225  transposase IS256  83.16 
 
 		 1197 bp  61.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.902645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2744  transposase IS256  83.16 
 
 		 1197 bp  61.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169837  normal  0.196457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3245    83.16 
 
 		 2780 bp  61.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.884067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3246  transposase IS256  83.16 
 
 		 1197 bp  61.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0352    92.86 
 
 		 1213 bp  60  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2275    83.7 
 
 		 123 bp  58  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1374  transposase, mutator type  82.18 
 
 		 1197 bp  58  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4911  transposase, mutator type  94.44 
 
 		 1212 bp  56  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.462522 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2108  transposase, mutator type  83.33 
 
 		 1209 bp  56  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.50702  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3612  transposase, mutator type  83.33 
 
 		 1209 bp  56  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0390226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3569  transposase, mutator type  83.33 
 
 		 1209 bp  56  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3572    84.72 
 
 		 291 bp  56  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5814  transposase, mutator type  84.51 
 
 		 1248 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242706  hitchhiker  0.000216578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0836  transposase, mutator type  84.51 
 
 		 1248 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.976413  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1035  transposase, mutator type  84.51 
 
 		 1248 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000123113  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1419  transposase, mutator type  84.51 
 
 		 1248 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1465  transposase, mutator type  84.51 
 
 		 1248 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1678  transposase, mutator type  84.51 
 
 		 1248 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1687  transposase, mutator type  84.51 
 
 		 1248 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4846  transposase, mutator type  84.51 
 
 		 1248 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5364  transposase, mutator type  84.51 
 
 		 1248 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5729  transposase, mutator type  84.51 
 
 		 1248 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5730  transposase, mutator type  84.51 
 
 		 1248 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0039  transposase, mutator type  84.51 
 
 		 1248 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290082 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4934  transposase, mutator type  84.51 
 
 		 1248 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4917  transposase, mutator type  84.51 
 
 		 1248 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1707  transposase, mutator type  84.51 
 
 		 189 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181873  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1488  transposase, mutator type  84.51 
 
 		 1248 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1437  transposase, mutator type  84.51 
 
 		 1248 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.515564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0949  transposase, mutator type  84.51 
 
 		 1248 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0823  transposase, mutator type  84.51 
 
 		 1248 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0431  transposase, mutator type  84.51 
 
 		 1248 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.668856  normal  0.200495 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5858  transposase, mutator type  84.51 
 
 		 1248 bp  54  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000919553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2468    100 
 
 		 1158 bp  52  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3267  transposase, mutator type  83.78 
 
 		 1248 bp  52  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0375  transposase mutator type  90.48 
 
 		 1233 bp  52  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1859  transposase mutator type  90.48 
 
 		 1233 bp  52  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2636  transposase mutator type  90.48 
 
 		 1233 bp  52  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2905  transposase mutator type  90.48 
 
 		 1233 bp  52  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4171  transposase mutator type  85.96 
 
 		 1155 bp  50.1  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0899    83.33 
 
 		 2433 bp  48.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.811127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>