107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0352 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2905  transposase mutator type  87.16 
 
 		 1233 bp  1126    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2636  transposase mutator type  87.16 
 
 		 1233 bp  1126    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1859  transposase mutator type  87.16 
 
 		 1233 bp  1126    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1573    87.43 
 
 		 1271 bp  1197    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0375  transposase mutator type  87.16 
 
 		 1233 bp  1126    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0352    100 
 
 		 1213 bp  2405    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0550  transposase, mutator type  81.35 
 
 		 1233 bp  424  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0581  transposase, mutator type  81.35 
 
 		 1233 bp  424  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0585  transposase, mutator type  81.35 
 
 		 1233 bp  424  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2959    87.01 
 
 		 425 bp  204  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331833  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0615    81.54 
 
 		 1229 bp  93.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13671  transposase  80.51 
 
 		 1230 bp  85.7  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.967269  normal  0.0391652 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0630  transposase, mutator type  82.19 
 
 		 1086 bp  83.8  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0688  transposase, mutator type  85.29 
 
 		 1236 bp  83.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0678  transposase, mutator type  84.21 
 
 		 1236 bp  69.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3191  transposase, mutator type  84.21 
 
 		 1236 bp  69.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.317024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3219  transposase, mutator type  87.32 
 
 		 1209 bp  69.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0790  transposase, mutator type  87.32 
 
 		 1209 bp  69.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0798  transposase, mutator type  87.32 
 
 		 1209 bp  69.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13950    84.71 
 
 		 123 bp  65.9  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3126  transposase, mutator type  89.29 
 
 		 1209 bp  63.9  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601222  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3172  transposase, mutator type  89.29 
 
 		 1209 bp  63.9  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15251  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3185  transposase, mutator type  89.29 
 
 		 1209 bp  63.9  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0504215  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1892    83 
 
 		 3611 bp  63.9  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1895    83 
 
 		 1291 bp  63.9  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3047    93.02 
 
 		 1184 bp  61.9  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  93.02 
 
 		 1200 bp  61.9  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  93.02 
 
 		 1200 bp  61.9  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1374  transposase, mutator type  97.14 
 
 		 1197 bp  61.9  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0836  transposase, mutator type  82.98 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.976413  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1035  transposase, mutator type  82.98 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000123113  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1419  transposase, mutator type  82.98 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1465  transposase, mutator type  82.98 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1678  transposase, mutator type  82.98 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1687  transposase, mutator type  82.98 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4846  transposase, mutator type  82.98 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5364  transposase, mutator type  82.98 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5729  transposase, mutator type  82.98 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5730  transposase, mutator type  82.98 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5755  transposase, mutator type  79.63 
 
 		 1236 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5814  transposase, mutator type  82.98 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242706  hitchhiker  0.000216578 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5858  transposase, mutator type  82.98 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000919553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0039  transposase, mutator type  82.98 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290082 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0431  transposase, mutator type  82.98 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.668856  normal  0.200495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0823  transposase, mutator type  82.98 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0949  transposase, mutator type  82.98 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1437  transposase, mutator type  82.98 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.515564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1488  transposase, mutator type  82.98 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4917  transposase, mutator type  82.98 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4934  transposase, mutator type  82.98 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5359  transposase, mutator type  79.63 
 
 		 1236 bp  60  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.502156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4911  transposase, mutator type  87.1 
 
 		 1212 bp  60  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.462522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2280    92.86 
 
 		 694 bp  60  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0221  transposase mutator type  83.72 
 
 		 1260 bp  60  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7079  transposase mutator type  83.72 
 
 		 1260 bp  60  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8623  transposase mutator type  83.72 
 
 		 1260 bp  60  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  0.594548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0700  transposase, mutator type  83.15 
 
 		 1287 bp  58  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0889  transposase, mutator type  83.15 
 
 		 1287 bp  58  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2876  transposase, mutator type  83.15 
 
 		 1287 bp  58  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3569  transposase, mutator type  88.68 
 
 		 1209 bp  58  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3612  transposase, mutator type  88.68 
 
 		 1209 bp  58  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0390226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2108  transposase, mutator type  88.68 
 
 		 1209 bp  58  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.50702  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3557    81.2 
 
 		 1246 bp  58  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000455542  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3679    81.2 
 
 		 1246 bp  58  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.119841  normal  0.0704481 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3693    81.2 
 
 		 1246 bp  58  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000194072  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3746    81.2 
 
 		 1246 bp  58  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00807242  normal  0.13138 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2922    100 
 
 		 399 bp  56  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0009  transposase  90.7 
 
 		 927 bp  54  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0014  transposase  90.7 
 
 		 927 bp  54  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3587    82.11 
 
 		 222 bp  54  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.028456 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  92.31 
 
 		 1200 bp  54  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  92.31 
 
 		 1200 bp  54  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1182  transposase mutator type  85.07 
 
 		 1248 bp  54  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1234  transposase mutator type  85.07 
 
 		 1248 bp  54  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.199668 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2565    90.48 
 
 		 228 bp  52  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  90.48 
 
 		 1200 bp  52  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  90.48 
 
 		 1200 bp  52  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2047    80.33 
 
 		 6126 bp  52  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.231348  decreased coverage  0.00652889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2072    80.33 
 
 		 1246 bp  52  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0667112  normal  0.0247017 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2883  transposase mutator type  80.33 
 
 		 1245 bp  52  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000527688  hitchhiker  0.001163 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5576  transposase, mutator type  93.94 
 
 		 1203 bp  50.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0631  putative transposase  90.24 
 
 		 147 bp  50.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5979  transposase, mutator type  93.94 
 
 		 1176 bp  50.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.640572 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  90.24 
 
 		 1200 bp  50.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  90.24 
 
 		 1200 bp  50.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  90.24 
 
 		 1200 bp  50.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1065    87.76 
 
 		 1039 bp  50.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1634    96.55 
 
 		 1113 bp  50.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0157  transposase mutator type  87.5 
 
 		 1209 bp  48.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0266  transposase mutator type  87.5 
 
 		 1209 bp  48.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.598198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0944  transposase mutator type  87.5 
 
 		 1209 bp  48.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2394  transposase mutator type  87.5 
 
 		 1209 bp  48.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3714  transposase mutator type  87.5 
 
 		 1209 bp  48.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3779  transposase mutator type  87.5 
 
 		 1209 bp  48.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688566  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3966  transposase mutator type  87.5 
 
 		 1209 bp  48.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4031  transposase mutator type  87.5 
 
 		 1209 bp  48.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4069  transposase mutator type  87.5 
 
 		 1209 bp  48.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4182  transposase mutator type  87.5 
 
 		 1209 bp  48.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5067  transposase mutator type  87.5 
 
 		 1209 bp  48.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5445  transposase mutator type  87.5 
 
 		 1209 bp  48.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>