69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0615 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0615    100 
 
 
1229 bp  2436    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0630  transposase, mutator type  99.91 
 
 
1086 bp  2145    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13671  transposase  80.84 
 
 
1230 bp  545  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.967269  normal  0.0391652 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0631  putative transposase  100 
 
 
147 bp  291  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5359  transposase, mutator type  81.72 
 
 
1236 bp  143  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.502156  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5755  transposase, mutator type  81.72 
 
 
1236 bp  143  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431676  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2905  transposase mutator type  82.29 
 
 
1233 bp  103  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0375  transposase mutator type  82.29 
 
 
1233 bp  103  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1859  transposase mutator type  82.29 
 
 
1233 bp  103  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2636  transposase mutator type  82.29 
 
 
1233 bp  103  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0352    81.54 
 
 
1213 bp  93.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1573    81.12 
 
 
1271 bp  87.7  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5979  transposase, mutator type  86.75 
 
 
1176 bp  77.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.640572 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5576  transposase, mutator type  86.75 
 
 
1203 bp  77.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0678  transposase, mutator type  86.75 
 
 
1236 bp  69.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3191  transposase, mutator type  86.75 
 
 
1236 bp  69.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.317024  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  93.48 
 
 
1200 bp  67.9  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  93.48 
 
 
1200 bp  67.9  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  93.48 
 
 
1200 bp  67.9  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  93.48 
 
 
1200 bp  67.9  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  93.48 
 
 
1200 bp  67.9  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1860  transposase mutator type  87.69 
 
 
801 bp  65.9  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.363503  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17950  transposase  88.14 
 
 
1251 bp  61.9  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.776929  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05430  transposase  88.14 
 
 
1251 bp  61.9  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25830  transposase  88.14 
 
 
1251 bp  61.9  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25910  transposase  88.14 
 
 
1251 bp  61.9  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0550  transposase, mutator type  88.71 
 
 
1233 bp  60  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0585  transposase, mutator type  88.71 
 
 
1233 bp  60  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390159  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0581  transposase, mutator type  88.71 
 
 
1233 bp  60  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3779  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  56  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688566  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17620  transposase  87.5 
 
 
1248 bp  56  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0181204  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09270  transposase  87.5 
 
 
1248 bp  56  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.681335  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06560  transposase  87.5 
 
 
1248 bp  56  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.796022 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5557  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  56  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.032396 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5445  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  56  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5067  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  56  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4226  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  56  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4182  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  56  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644517  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4031  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  56  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0475    90.91 
 
 
715 bp  56  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.920505  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0157  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  56  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0266  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  56  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.598198  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0343  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  56  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0943    87.5 
 
 
3399 bp  56  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0944  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  56  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2394  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  56  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3714  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  56  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4069  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  56  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.291229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3966  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  56  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3267  transposase, mutator type  86.44 
 
 
1248 bp  54  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2883  transposase mutator type  92.11 
 
 
1245 bp  52  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000527688  hitchhiker  0.001163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2072    92.11 
 
 
1246 bp  52  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0667112  normal  0.0247017 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3972  arginyl-tRNA synthetase  91.67 
 
 
1653 bp  48.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3898  arginyl-tRNA synthetase  91.67 
 
 
1653 bp  48.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0879275  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  93.75 
 
 
1200 bp  48.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3884  arginyl-tRNA synthetase  91.67 
 
 
1653 bp  48.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103344  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13468  transposase  85.71 
 
 
846 bp  48.1  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0327912  hitchhiker  0.000514012 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3132  transposase mutator type  90 
 
 
1218 bp  48.1  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1904  transposase mutator type  90 
 
 
1218 bp  48.1  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1539  transposase mutator type  90 
 
 
1218 bp  48.1  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1531  transposase mutator type  90 
 
 
1218 bp  48.1  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1530    90 
 
 
3230 bp  48.1  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1513  transposase mutator type  90 
 
 
1218 bp  48.1  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.688883  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1511  transposase mutator type  90 
 
 
1218 bp  48.1  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.647595  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0112  transposase mutator type  90 
 
 
1218 bp  48.1  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10460  Transposase, Mutator family  96.43 
 
 
1269 bp  48.1  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000746086  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10440  Transposase, Mutator family  96.43 
 
 
1269 bp  48.1  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000572407  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  88.64 
 
 
1200 bp  48.1  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  93.75 
 
 
1200 bp  48.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>