38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0475 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0475    100 
 
 		 715 bp  1417    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.920505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  86.21 
 
 		 1200 bp  387  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1860  transposase mutator type  85.19 
 
 		 801 bp  377  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.363503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  84.55 
 
 		 1200 bp  353  4e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  85.41 
 
 		 1200 bp  351  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  85.41 
 
 		 1200 bp  351  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  85.41 
 
 		 1200 bp  351  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  85.18 
 
 		 1200 bp  343  4e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2516  transposase mutator type  84.13 
 
 		 444 bp  272  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5006  transposase mutator type  83.33 
 
 		 1014 bp  270  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570221  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  82.19 
 
 		 1200 bp  266  8e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  82.19 
 
 		 1200 bp  266  8e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  81.38 
 
 		 1200 bp  190  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  81.38 
 
 		 1200 bp  190  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1880    84.96 
 
 		 723 bp  178  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1065    80.51 
 
 		 1039 bp  137  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6213    81.48 
 
 		 2705 bp  119  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3047    79.12 
 
 		 1184 bp  119  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0009  transposase  84.29 
 
 		 927 bp  103  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0014  transposase  84.29 
 
 		 927 bp  103  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2280    82.5 
 
 		 694 bp  89.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0008  putative fragment of transposase protein  90.14 
 
 		 252 bp  85.7  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0015  putative fragment of transposase protein  90.14 
 
 		 252 bp  85.7  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0395238  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5004    82.27 
 
 		 477 bp  81.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0511261  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6345  transposase mutator type  77.59 
 
 		 558 bp  73.8  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442764  normal  0.442259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2275    82.76 
 
 		 123 bp  71.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2565    83.65 
 
 		 228 bp  71.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2922    84.04 
 
 		 399 bp  67.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3134    84.78 
 
 		 214 bp  63.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0102047 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2904  transposase  80.95 
 
 		 408 bp  60  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3235    90.91 
 
 		 261 bp  56  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257318  normal  0.453735 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0615    90.91 
 
 		 1229 bp  56  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0630  transposase, mutator type  90.91 
 
 		 1086 bp  56  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3616  transposase  90.91 
 
 		 288 bp  56  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2108  transposase, mutator type  90.48 
 
 		 1209 bp  52  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.50702  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3612  transposase, mutator type  90.48 
 
 		 1209 bp  52  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0390226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3569  transposase, mutator type  90.48 
 
 		 1209 bp  52  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1438    83.12 
 
 		 457 bp  50.1  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>