16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2275 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2275    100 
 
 		 123 bp  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  89.43 
 
 		 1200 bp  141  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  89.43 
 
 		 1200 bp  141  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  89.43 
 
 		 1200 bp  141  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  86.99 
 
 		 1200 bp  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  86.99 
 
 		 1200 bp  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  86.21 
 
 		 1200 bp  103  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1880    85.71 
 
 		 723 bp  101  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3047    85.88 
 
 		 1184 bp  73.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  85.88 
 
 		 1200 bp  73.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  85.88 
 
 		 1200 bp  73.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0475    82.76 
 
 		 715 bp  71.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.920505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3134    88.52 
 
 		 214 bp  65.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0102047 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2280    83.7 
 
 		 694 bp  58  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2922    92.11 
 
 		 399 bp  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1676  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 		 504 bp  44.1  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549233  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>