43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3134 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3134    100 
 
 
214 bp  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0102047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  85.38 
 
 
1200 bp  159  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  85.38 
 
 
1200 bp  159  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1880    84.26 
 
 
723 bp  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  83.96 
 
 
1200 bp  135  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  83.96 
 
 
1200 bp  135  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  83.96 
 
 
1200 bp  135  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  83.02 
 
 
1200 bp  119  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2280    83.23 
 
 
694 bp  89.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  88.04 
 
 
1200 bp  87.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  88.04 
 
 
1200 bp  87.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2922    88.31 
 
 
399 bp  73.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205928  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3047    85.87 
 
 
1184 bp  71.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2275    88.52 
 
 
123 bp  65.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0475    84.78 
 
 
715 bp  63.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.920505  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  90.91 
 
 
1200 bp  61.9  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  90.91 
 
 
1200 bp  61.9  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1065    96.97 
 
 
1039 bp  58  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0014  transposase  82.91 
 
 
927 bp  58  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6213    91.11 
 
 
2705 bp  58  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0009  transposase  82.91 
 
 
927 bp  58  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5814  transposase, mutator type  87.76 
 
 
1248 bp  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242706  hitchhiker  0.000216578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0836  transposase, mutator type  87.76 
 
 
1248 bp  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.976413  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1035  transposase, mutator type  87.76 
 
 
1248 bp  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000123113  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1419  transposase, mutator type  87.76 
 
 
1248 bp  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1465  transposase, mutator type  87.76 
 
 
1248 bp  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1678  transposase, mutator type  87.76 
 
 
1248 bp  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1687  transposase, mutator type  87.76 
 
 
1248 bp  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4846  transposase, mutator type  87.76 
 
 
1248 bp  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5364  transposase, mutator type  87.76 
 
 
1248 bp  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5729  transposase, mutator type  87.76 
 
 
1248 bp  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5730  transposase, mutator type  87.76 
 
 
1248 bp  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0823  transposase, mutator type  87.76 
 
 
1248 bp  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5858  transposase, mutator type  87.76 
 
 
1248 bp  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000919553  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0039  transposase, mutator type  87.76 
 
 
1248 bp  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290082 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0431  transposase, mutator type  87.76 
 
 
1248 bp  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.668856  normal  0.200495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3267  transposase, mutator type  87.76 
 
 
1248 bp  50.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4934  transposase, mutator type  87.76 
 
 
1248 bp  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166012  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4917  transposase, mutator type  87.76 
 
 
1248 bp  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878139  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1707  transposase, mutator type  87.76 
 
 
189 bp  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181873  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1488  transposase, mutator type  87.76 
 
 
1248 bp  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685723  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1437  transposase, mutator type  87.76 
 
 
1248 bp  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.515564  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0949  transposase, mutator type  87.76 
 
 
1248 bp  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>