67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2922 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2922    100 
 
 		 399 bp  791    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  92.7 
 
 		 1200 bp  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  92.7 
 
 		 1200 bp  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3047    90.93 
 
 		 1184 bp  502  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2280    85.64 
 
 		 694 bp  329  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1065    85.42 
 
 		 1039 bp  323  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2128  transposase, mutator type  82.56 
 
 		 468 bp  163  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.449064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  88.64 
 
 		 1200 bp  135  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  88.64 
 
 		 1200 bp  135  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  88.64 
 
 		 1200 bp  135  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0009  transposase  86.36 
 
 		 927 bp  131  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0014  transposase  86.36 
 
 		 927 bp  131  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  87.5 
 
 		 1200 bp  127  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  87.69 
 
 		 1200 bp  123  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  87.69 
 
 		 1200 bp  123  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  84.94 
 
 		 1200 bp  123  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  84.94 
 
 		 1200 bp  123  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1880    86.03 
 
 		 723 bp  111  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6213    85.5 
 
 		 2705 bp  101  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2565    83.33 
 
 		 228 bp  91.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3267  transposase, mutator type  89.19 
 
 		 1248 bp  83.8  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3616  transposase  83.46 
 
 		 288 bp  81.8  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0823  transposase, mutator type  88.73 
 
 		 1248 bp  77.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0836  transposase, mutator type  88.73 
 
 		 1248 bp  77.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.976413  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1035  transposase, mutator type  88.73 
 
 		 1248 bp  77.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000123113  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1419  transposase, mutator type  88.73 
 
 		 1248 bp  77.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1465  transposase, mutator type  88.73 
 
 		 1248 bp  77.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1678  transposase, mutator type  88.73 
 
 		 1248 bp  77.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1687  transposase, mutator type  88.73 
 
 		 1248 bp  77.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4846  transposase, mutator type  88.73 
 
 		 1248 bp  77.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5364  transposase, mutator type  88.73 
 
 		 1248 bp  77.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5729  transposase, mutator type  88.73 
 
 		 1248 bp  77.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5730  transposase, mutator type  88.73 
 
 		 1248 bp  77.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5814  transposase, mutator type  88.73 
 
 		 1248 bp  77.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242706  hitchhiker  0.000216578 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5858  transposase, mutator type  88.73 
 
 		 1248 bp  77.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000919553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1707  transposase, mutator type  88.73 
 
 		 189 bp  77.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181873  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0431  transposase, mutator type  88.73 
 
 		 1248 bp  77.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.668856  normal  0.200495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0039  transposase, mutator type  88.73 
 
 		 1248 bp  77.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290082 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0949  transposase, mutator type  88.73 
 
 		 1248 bp  77.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1437  transposase, mutator type  88.73 
 
 		 1248 bp  77.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.515564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1488  transposase, mutator type  88.73 
 
 		 1248 bp  77.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4917  transposase, mutator type  88.73 
 
 		 1248 bp  77.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4934  transposase, mutator type  88.73 
 
 		 1248 bp  77.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3134    88.31 
 
 		 214 bp  73.8  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0102047 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5004    92.73 
 
 		 477 bp  69.9  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0511261  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0475    84.04 
 
 		 715 bp  67.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.920505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2775    97.3 
 
 		 319 bp  65.9  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2905  transposase mutator type  100 
 
 		 1233 bp  56  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0352    100 
 
 		 1213 bp  56  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0375  transposase mutator type  100 
 
 		 1233 bp  56  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1859  transposase mutator type  100 
 
 		 1233 bp  56  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2636  transposase mutator type  100 
 
 		 1233 bp  56  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2225  transposase IS256  84.51 
 
 		 1197 bp  54  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.902645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2744  transposase IS256  84.51 
 
 		 1197 bp  54  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169837  normal  0.196457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3245    84.51 
 
 		 2780 bp  54  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.884067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3246  transposase IS256  84.51 
 
 		 1197 bp  54  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1760  transposase IS256  84.51 
 
 		 1197 bp  54  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.534749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0170  transposase IS256  84.51 
 
 		 1197 bp  54  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452529  hitchhiker  0.00578172 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2275    92.11 
 
 		 123 bp  52  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0550  transposase, mutator type  96.55 
 
 		 1233 bp  50.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0581  transposase, mutator type  96.55 
 
 		 1233 bp  50.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0261  hypothetical protein  96.55 
 
 		 834 bp  50.1  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0585  transposase, mutator type  96.55 
 
 		 1233 bp  50.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0899    96.43 
 
 		 2433 bp  48.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.811127 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 675 bp  46.1  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1573    96.3 
 
 		 1271 bp  46.1  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4125    80.49 
 
 		 213 bp  46.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>