41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2775 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2775    100 
 
 
319 bp  632  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0183    95.56 
 
 
178 bp  220  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  89.17 
 
 
1200 bp  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  89.17 
 
 
1200 bp  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4173    91.67 
 
 
174 bp  174  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  88.71 
 
 
1200 bp  135  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  88.71 
 
 
1200 bp  135  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  88.71 
 
 
1200 bp  135  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5004    85.71 
 
 
477 bp  131  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0511261  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1880    86.62 
 
 
723 bp  131  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  83.55 
 
 
1200 bp  103  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2280    95.92 
 
 
694 bp  81.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  92.73 
 
 
1200 bp  77.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  92.73 
 
 
1200 bp  77.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5557  transposase mutator type  89.39 
 
 
1209 bp  75.8  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.032396 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0014  transposase  91.23 
 
 
927 bp  73.8  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0009  transposase  91.23 
 
 
927 bp  73.8  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3047    91.23 
 
 
1184 bp  73.8  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5067  transposase mutator type  87.88 
 
 
1209 bp  67.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5445  transposase mutator type  87.88 
 
 
1209 bp  67.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0157  transposase mutator type  87.88 
 
 
1209 bp  67.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4226  transposase mutator type  87.88 
 
 
1209 bp  67.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4182  transposase mutator type  87.88 
 
 
1209 bp  67.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644517  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4069  transposase mutator type  87.88 
 
 
1209 bp  67.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.291229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4031  transposase mutator type  87.88 
 
 
1209 bp  67.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3966  transposase mutator type  87.88 
 
 
1209 bp  67.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3779  transposase mutator type  87.88 
 
 
1209 bp  67.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688566  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3714  transposase mutator type  87.88 
 
 
1209 bp  67.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2394  transposase mutator type  87.88 
 
 
1209 bp  67.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0944  transposase mutator type  87.88 
 
 
1209 bp  67.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0943    87.88 
 
 
3399 bp  67.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0343  transposase mutator type  87.88 
 
 
1209 bp  67.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0266  transposase mutator type  87.88 
 
 
1209 bp  67.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.598198  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1065    89.47 
 
 
1039 bp  65.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2922    97.3 
 
 
399 bp  65.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205928  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  88.24 
 
 
1200 bp  54  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  88.24 
 
 
1200 bp  54  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4911  transposase, mutator type  94.12 
 
 
1212 bp  52  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.462522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1925    93.75 
 
 
596 bp  48.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2973  Phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 
2784 bp  48.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2565    85.45 
 
 
228 bp  46.1  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>