93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1065 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2280    87.31 
 
 		 694 bp  640    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1065    100 
 
 		 1039 bp  2060    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3047    89.12 
 
 		 1184 bp  733    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  89.3 
 
 		 1200 bp  755    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  89.3 
 
 		 1200 bp  755    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2128  transposase, mutator type  85.9 
 
 		 468 bp  385  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.449064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  81.62 
 
 		 1200 bp  329  9e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2922    85.42 
 
 		 399 bp  323  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  81.18 
 
 		 1200 bp  307  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1880    81.88 
 
 		 723 bp  301  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  80.75 
 
 		 1200 bp  283  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  80.75 
 
 		 1200 bp  283  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  80.31 
 
 		 1200 bp  252  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  80.31 
 
 		 1200 bp  252  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  79.94 
 
 		 1200 bp  244  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  79.94 
 
 		 1200 bp  244  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6213    83.52 
 
 		 2705 bp  240  7e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1860  transposase mutator type  83.57 
 
 		 801 bp  236  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.363503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2516  transposase mutator type  82.42 
 
 		 444 bp  204  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5006  transposase mutator type  83.39 
 
 		 1014 bp  196  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570221  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0009  transposase  85.06 
 
 		 927 bp  184  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0014  transposase  85.06 
 
 		 927 bp  184  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5004    82.29 
 
 		 477 bp  157  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0511261  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6345  transposase mutator type  80.39 
 
 		 558 bp  155  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442764  normal  0.442259 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0475    80.51 
 
 		 715 bp  137  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.920505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2904  transposase  85.71 
 
 		 408 bp  137  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0015  putative fragment of transposase protein  84.71 
 
 		 252 bp  117  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0395238  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0008  putative fragment of transposase protein  84.71 
 
 		 252 bp  117  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1438    82.61 
 
 		 457 bp  89.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2744  transposase IS256  83.33 
 
 		 1197 bp  71.9  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169837  normal  0.196457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3246  transposase IS256  83.33 
 
 		 1197 bp  71.9  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3245    83.33 
 
 		 2780 bp  71.9  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.884067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0170  transposase IS256  83.33 
 
 		 1197 bp  71.9  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452529  hitchhiker  0.00578172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0899    83.33 
 
 		 2433 bp  71.9  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.811127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1760  transposase IS256  83.33 
 
 		 1197 bp  71.9  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.534749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2225  transposase IS256  83.33 
 
 		 1197 bp  71.9  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.902645 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2775    89.47 
 
 		 319 bp  65.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5814  transposase, mutator type  86.11 
 
 		 1248 bp  63.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242706  hitchhiker  0.000216578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4846  transposase, mutator type  86.11 
 
 		 1248 bp  63.9  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1687  transposase, mutator type  86.11 
 
 		 1248 bp  63.9  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1678  transposase, mutator type  86.11 
 
 		 1248 bp  63.9  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1465  transposase, mutator type  86.11 
 
 		 1248 bp  63.9  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1419  transposase, mutator type  86.11 
 
 		 1248 bp  63.9  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1035  transposase, mutator type  86.11 
 
 		 1248 bp  63.9  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000123113  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0836  transposase, mutator type  86.11 
 
 		 1248 bp  63.9  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.976413  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5730  transposase, mutator type  86.11 
 
 		 1248 bp  63.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3235    81.06 
 
 		 261 bp  63.9  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257318  normal  0.453735 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5729  transposase, mutator type  86.11 
 
 		 1248 bp  63.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5858  transposase, mutator type  86.11 
 
 		 1248 bp  63.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000919553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0039  transposase, mutator type  86.11 
 
 		 1248 bp  63.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290082 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0431  transposase, mutator type  86.11 
 
 		 1248 bp  63.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.668856  normal  0.200495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0823  transposase, mutator type  86.11 
 
 		 1248 bp  63.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0949  transposase, mutator type  86.11 
 
 		 1248 bp  63.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1437  transposase, mutator type  86.11 
 
 		 1248 bp  63.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.515564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1488  transposase, mutator type  86.11 
 
 		 1248 bp  63.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1707  transposase, mutator type  86.11 
 
 		 189 bp  63.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181873  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4917  transposase, mutator type  86.11 
 
 		 1248 bp  63.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4934  transposase, mutator type  86.11 
 
 		 1248 bp  63.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13671  transposase  89.29 
 
 		 1230 bp  63.9  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.967269  normal  0.0391652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5364  transposase, mutator type  86.11 
 
 		 1248 bp  63.9  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3267  transposase, mutator type  85.33 
 
 		 1248 bp  61.9  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3126  transposase, mutator type  86.36 
 
 		 1209 bp  60  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601222  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3172  transposase, mutator type  86.36 
 
 		 1209 bp  60  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15251  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3185  transposase, mutator type  86.36 
 
 		 1209 bp  60  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0504215  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3219  transposase, mutator type  86.36 
 
 		 1209 bp  60  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0790  transposase, mutator type  86.36 
 
 		 1209 bp  60  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0798  transposase, mutator type  86.36 
 
 		 1209 bp  60  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3134    96.97 
 
 		 214 bp  58  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0102047 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2565    83.95 
 
 		 228 bp  58  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3616  transposase  79.62 
 
 		 288 bp  58  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4031  transposase mutator type  89.36 
 
 		 1209 bp  54  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5557  transposase mutator type  89.36 
 
 		 1209 bp  54  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.032396 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0157  transposase mutator type  89.36 
 
 		 1209 bp  54  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0266  transposase mutator type  89.36 
 
 		 1209 bp  54  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.598198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0343  transposase mutator type  89.36 
 
 		 1209 bp  54  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0943    89.36 
 
 		 3399 bp  54  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0944  transposase mutator type  89.36 
 
 		 1209 bp  54  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2394  transposase mutator type  89.36 
 
 		 1209 bp  54  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3714  transposase mutator type  89.36 
 
 		 1209 bp  54  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3779  transposase mutator type  89.36 
 
 		 1209 bp  54  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688566  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5445  transposase mutator type  89.36 
 
 		 1209 bp  54  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5067  transposase mutator type  89.36 
 
 		 1209 bp  54  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4226  transposase mutator type  89.36 
 
 		 1209 bp  54  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4182  transposase mutator type  89.36 
 
 		 1209 bp  54  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4069  transposase mutator type  89.36 
 
 		 1209 bp  54  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3966  transposase mutator type  89.36 
 
 		 1209 bp  54  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4911  transposase, mutator type  92.11 
 
 		 1212 bp  52  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.462522 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01800  transposase  96.67 
 
 		 1257 bp  52  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02400    96.67 
 
 		 1318 bp  52  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.421042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4171  transposase mutator type  83.56 
 
 		 1155 bp  50.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2468    100 
 
 		 1158 bp  50.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3651    87.76 
 
 		 370 bp  50.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0352    87.76 
 
 		 1213 bp  50.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>