93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02400 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_01800  transposase  99.92 
 
 		 1257 bp  2478    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02400    100 
 
 		 1318 bp  2613    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.421042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20580    81.17 
 
 		 2258 bp  587  1.0000000000000001e-165  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06560  transposase  81.17 
 
 		 1248 bp  577  1.0000000000000001e-162  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.796022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09270  transposase  81.17 
 
 		 1248 bp  577  1.0000000000000001e-162  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.681335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17620  transposase  81.17 
 
 		 1248 bp  577  1.0000000000000001e-162  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0181204  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0836  transposase, mutator type  81.6 
 
 		 1248 bp  521  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.976413  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25910  transposase  80.64 
 
 		 1251 bp  521  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4934  transposase, mutator type  81.6 
 
 		 1248 bp  521  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4917  transposase, mutator type  81.6 
 
 		 1248 bp  521  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1488  transposase, mutator type  81.6 
 
 		 1248 bp  521  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1437  transposase, mutator type  81.6 
 
 		 1248 bp  521  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.515564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0949  transposase, mutator type  81.6 
 
 		 1248 bp  521  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0823  transposase, mutator type  81.6 
 
 		 1248 bp  521  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0039  transposase, mutator type  81.6 
 
 		 1248 bp  521  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1419  transposase, mutator type  81.6 
 
 		 1248 bp  521  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0431  transposase, mutator type  81.6 
 
 		 1248 bp  521  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.668856  normal  0.200495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1035  transposase, mutator type  81.6 
 
 		 1248 bp  521  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000123113  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4846  transposase, mutator type  81.6 
 
 		 1248 bp  521  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1687  transposase, mutator type  81.6 
 
 		 1248 bp  521  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5364  transposase, mutator type  81.6 
 
 		 1248 bp  521  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5729  transposase, mutator type  81.6 
 
 		 1248 bp  521  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1678  transposase, mutator type  81.6 
 
 		 1248 bp  521  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1465  transposase, mutator type  81.6 
 
 		 1248 bp  521  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5730  transposase, mutator type  81.6 
 
 		 1248 bp  521  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5814  transposase, mutator type  81.6 
 
 		 1248 bp  521  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242706  hitchhiker  0.000216578 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5858  transposase, mutator type  81.6 
 
 		 1248 bp  521  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000919553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00300  transposase, mutator family  80.72 
 
 		 1254 bp  515  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00410  transposase, mutator family  80.72 
 
 		 1254 bp  515  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00420  transposase, mutator family  80.72 
 
 		 1254 bp  515  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02160  transposase, mutator family  80.72 
 
 		 1254 bp  515  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03110  transposase, mutator family  80.72 
 
 		 1254 bp  515  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.529932  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12080  transposase, mutator family  80.72 
 
 		 1254 bp  515  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0258594  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12170  transposase, mutator family  80.72 
 
 		 1254 bp  515  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20590  transposase, mutator family  80.72 
 
 		 1254 bp  515  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05430  transposase  80.47 
 
 		 1251 bp  505  1e-141  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25830  transposase  80.47 
 
 		 1251 bp  505  1e-141  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17950  transposase  80.47 
 
 		 1251 bp  505  1e-141  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.776929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10260  transposase, mutator family  80.54 
 
 		 1254 bp  494  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16090  transposase  81.26 
 
 		 1173 bp  480  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.559374  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3267  transposase, mutator type  81.11 
 
 		 1248 bp  482  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05430  transposase, mutator family  80.49 
 
 		 1254 bp  478  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.236758  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20500  transposase, mutator family  80.49 
 
 		 1254 bp  478  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03400  transposase, mutator family  80.4 
 
 		 1254 bp  470  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1703  transposase, mutator type  80.24 
 
 		 1182 bp  341  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0813455  normal  0.663406 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16160  transposase  80.09 
 
 		 777 bp  256  1e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16140    84.68 
 
 		 423 bp  240  8e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16080    83.59 
 
 		 333 bp  178  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1707  transposase, mutator type  89.6 
 
 		 189 bp  145  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181873  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0688  transposase, mutator type  82.29 
 
 		 1236 bp  101  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3665    78.83 
 
 		 432 bp  99.6  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1182  transposase mutator type  80.41 
 
 		 1248 bp  83.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1234  transposase mutator type  80.41 
 
 		 1248 bp  83.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.199668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3679    78.95 
 
 		 1246 bp  83.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.119841  normal  0.0704481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8623  transposase mutator type  83.93 
 
 		 1260 bp  79.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  0.594548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7079  transposase mutator type  83.93 
 
 		 1260 bp  79.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0221  transposase mutator type  83.93 
 
 		 1260 bp  79.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13135  transposase  83.19 
 
 		 1311 bp  77.8  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.15098 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13039  transposase  83.19 
 
 		 1248 bp  77.8  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7584e-95  decreased coverage  0.000658378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12681  hypothetical protein  83.19 
 
 		 804 bp  77.8  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.001544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12534  transposase  83.19 
 
 		 1248 bp  77.8  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.922715  decreased coverage  0.00121453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11223  transposase  83.19 
 
 		 1248 bp  77.8  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000146016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11065  transposase  83.19 
 
 		 1248 bp  77.8  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.540843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2876  transposase, mutator type  83.64 
 
 		 1287 bp  75.8  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3746    78.57 
 
 		 1246 bp  75.8  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00807242  normal  0.13138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3693    78.57 
 
 		 1246 bp  75.8  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000194072  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0700  transposase, mutator type  83.64 
 
 		 1287 bp  75.8  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0889  transposase, mutator type  83.64 
 
 		 1287 bp  75.8  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0587  hypothetical protein  93.75 
 
 		 336 bp  71.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3557    78.2 
 
 		 1246 bp  67.9  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000455542  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2883  transposase mutator type  78.2 
 
 		 1245 bp  67.9  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000527688  hitchhiker  0.001163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2072    78.2 
 
 		 1246 bp  67.9  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0667112  normal  0.0247017 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2047    78.2 
 
 		 6126 bp  67.9  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.231348  decreased coverage  0.00652889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3032  transposase mutator type  84.71 
 
 		 1242 bp  65.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4611  transposase mutator type  84.71 
 
 		 1242 bp  65.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.310217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3587    80.85 
 
 		 222 bp  65.9  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.028456 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2875  hypothetical protein  84.71 
 
 		 369 bp  65.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.302821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1371  transposase, mutator type  84.71 
 
 		 450 bp  65.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0454  transposase, mutator type  87.1 
 
 		 1062 bp  60  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3191  transposase, mutator type  92.86 
 
 		 1236 bp  60  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.317024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0678  transposase, mutator type  92.86 
 
 		 1236 bp  60  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5496  transposase, mutator type  79.35 
 
 		 1062 bp  54  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512335 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13950    83.33 
 
 		 123 bp  52  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1065    96.67 
 
 		 1039 bp  52  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3590  transposase, mutator type  80.33 
 
 		 1113 bp  52  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127182 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5356  transposase, mutator type  80.14 
 
 		 1287 bp  52  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7895  NAD-glutamate dehydrogenase  100 
 
 		 4971 bp  50.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  100 
 
 		 801 bp  48.1  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1780  cell wall anchor domain-containing protein  93.75 
 
 		 1083 bp  48.1  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.31813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1239  ABC transporter related  100 
 
 		 879 bp  48.1  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.469823  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1124  hypothetical protein  100 
 
 		 1374 bp  48.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1072  polysaccharide export protein  100 
 
 		 1272 bp  48.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.660733  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1252  hypothetical protein  100 
 
 		 1209 bp  48.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000927427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>