101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3679 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1182  transposase mutator type  96.01 
 
 
1248 bp  1957    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1234  transposase mutator type  96.01 
 
 
1248 bp  1957    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.199668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2047    98.72 
 
 
6126 bp  1762    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.231348  decreased coverage  0.00652889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2072    97.91 
 
 
1246 bp  2264    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0667112  normal  0.0247017 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2883  transposase mutator type  97.75 
 
 
1245 bp  2240    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000527688  hitchhiker  0.001163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3557    99.44 
 
 
1246 bp  2415    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000455542  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3679    100 
 
 
1246 bp  2470    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.119841  normal  0.0704481 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3693    99.76 
 
 
1246 bp  2446    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000194072  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3746    99.76 
 
 
1246 bp  2446    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00807242  normal  0.13138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0688  transposase, mutator type  78.74 
 
 
1236 bp  297  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11065  transposase  81.24 
 
 
1248 bp  272  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.540843 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11223  transposase  81.24 
 
 
1248 bp  272  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000146016  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12534  transposase  81.24 
 
 
1248 bp  272  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.922715  decreased coverage  0.00121453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13039  transposase  81.24 
 
 
1248 bp  272  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7584e-95  decreased coverage  0.000658378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13135  transposase  81.24 
 
 
1311 bp  272  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.15098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0700  transposase, mutator type  78.39 
 
 
1287 bp  268  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0889  transposase, mutator type  78.39 
 
 
1287 bp  268  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2876  transposase, mutator type  78.39 
 
 
1287 bp  268  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0401    93.6 
 
 
234 bp  254  5e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0221  transposase mutator type  87.67 
 
 
1260 bp  220  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7079  transposase mutator type  87.67 
 
 
1260 bp  220  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8623  transposase mutator type  87.67 
 
 
1260 bp  220  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  0.594548 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5356  transposase, mutator type  87.56 
 
 
1287 bp  208  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116782  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3590  transposase, mutator type  80.08 
 
 
1113 bp  198  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0127182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5496  transposase, mutator type  77.79 
 
 
1062 bp  196  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0512335 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3665    86.05 
 
 
432 bp  188  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3267  transposase, mutator type  87.71 
 
 
1248 bp  180  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3587    92.24 
 
 
222 bp  159  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.028456 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0836  transposase, mutator type  86.03 
 
 
1248 bp  157  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.976413  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1035  transposase, mutator type  86.03 
 
 
1248 bp  157  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000123113  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1419  transposase, mutator type  86.03 
 
 
1248 bp  157  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1465  transposase, mutator type  86.03 
 
 
1248 bp  157  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1678  transposase, mutator type  86.03 
 
 
1248 bp  157  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1687  transposase, mutator type  86.03 
 
 
1248 bp  157  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4846  transposase, mutator type  86.03 
 
 
1248 bp  157  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5364  transposase, mutator type  86.03 
 
 
1248 bp  157  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5729  transposase, mutator type  86.03 
 
 
1248 bp  157  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5730  transposase, mutator type  86.03 
 
 
1248 bp  157  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5814  transposase, mutator type  86.03 
 
 
1248 bp  157  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242706  hitchhiker  0.000216578 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5858  transposase, mutator type  86.03 
 
 
1248 bp  157  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000919553  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0039  transposase, mutator type  86.03 
 
 
1248 bp  157  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290082 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0431  transposase, mutator type  86.03 
 
 
1248 bp  157  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.668856  normal  0.200495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0823  transposase, mutator type  86.03 
 
 
1248 bp  157  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0949  transposase, mutator type  86.03 
 
 
1248 bp  157  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1437  transposase, mutator type  86.03 
 
 
1248 bp  157  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.515564  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1488  transposase, mutator type  86.03 
 
 
1248 bp  157  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685723  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4917  transposase, mutator type  86.03 
 
 
1248 bp  157  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878139  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4934  transposase, mutator type  86.03 
 
 
1248 bp  157  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166012  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0454  transposase, mutator type  77.96 
 
 
1062 bp  123  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3032  transposase mutator type  82.38 
 
 
1242 bp  123  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4611  transposase mutator type  82.38 
 
 
1242 bp  123  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.310217  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1368  transposase mutator type  82.74 
 
 
1623 bp  121  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2881    82.74 
 
 
783 bp  121  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06560  transposase  84.71 
 
 
1248 bp  121  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.796022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09270  transposase  84.71 
 
 
1248 bp  121  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.681335  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17620  transposase  84.71 
 
 
1248 bp  121  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0181204  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12681  hypothetical protein  86.99 
 
 
804 bp  117  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.001544  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1371  transposase, mutator type  82.54 
 
 
450 bp  113  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1707  transposase, mutator type  90.59 
 
 
189 bp  105  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181873  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00300  transposase, mutator family  87.13 
 
 
1254 bp  97.6  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00410  transposase, mutator family  87.13 
 
 
1254 bp  97.6  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00420  transposase, mutator family  87.13 
 
 
1254 bp  97.6  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02160  transposase, mutator family  87.13 
 
 
1254 bp  97.6  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03110  transposase, mutator family  87.13 
 
 
1254 bp  97.6  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.529932  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12080  transposase, mutator family  87.13 
 
 
1254 bp  97.6  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0258594  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12170  transposase, mutator family  87.13 
 
 
1254 bp  97.6  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16090  transposase  87.13 
 
 
1173 bp  97.6  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.559374  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20580    87.13 
 
 
2258 bp  97.6  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20590  transposase, mutator family  87.13 
 
 
1254 bp  97.6  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25910  transposase  80.35 
 
 
1251 bp  97.6  7e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5761    86.54 
 
 
177 bp  95.6  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2875  hypothetical protein  84.55 
 
 
369 bp  93.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.302821 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03400  transposase, mutator family  86.14 
 
 
1254 bp  89.7  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05430  transposase  79.74 
 
 
1251 bp  85.7  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17950  transposase  79.74 
 
 
1251 bp  85.7  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.776929  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25830  transposase  79.74 
 
 
1251 bp  85.7  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05430  transposase, mutator family  84.55 
 
 
1254 bp  83.8  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.236758  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20500  transposase, mutator family  84.55 
 
 
1254 bp  83.8  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01800  transposase  78.95 
 
 
1257 bp  83.8  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02400    78.95 
 
 
1318 bp  83.8  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.421042  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16080    79.31 
 
 
333 bp  79.8  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10260  transposase, mutator family  94 
 
 
1254 bp  75.8  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16160  transposase  94 
 
 
777 bp  75.8  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13950    85.71 
 
 
123 bp  65.9  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0457    82.35 
 
 
180 bp  60  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16140    79.19 
 
 
423 bp  58  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0352    81.2 
 
 
1213 bp  58  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5755  transposase, mutator type  85.94 
 
 
1236 bp  56  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431676  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5359  transposase, mutator type  85.94 
 
 
1236 bp  56  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.502156  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5499    86.44 
 
 
132 bp  54  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.599163  normal  0.0438022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13671  transposase  89.36 
 
 
1230 bp  54  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.967269  normal  0.0391652 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0587  hypothetical protein  96.55 
 
 
336 bp  50.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  96.55 
 
 
2271 bp  50.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0375  transposase mutator type  83.56 
 
 
1233 bp  50.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1859  transposase mutator type  83.56 
 
 
1233 bp  50.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2636  transposase mutator type  83.56 
 
 
1233 bp  50.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2905  transposase mutator type  83.56 
 
 
1233 bp  50.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0885    93.75 
 
 
1174 bp  48.1  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4911  transposase, mutator type  100 
 
 
1212 bp  48.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.462522 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0767    87.5 
 
 
1309 bp  48.1  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.794836  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>