96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3587 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3587    100 
 
 
222 bp  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.028456 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5356  transposase, mutator type  91.55 
 
 
1287 bp  280  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116782  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2876  transposase, mutator type  90.05 
 
 
1287 bp  264  8.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0889  transposase, mutator type  90.05 
 
 
1287 bp  264  8.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0700  transposase, mutator type  90.05 
 
 
1287 bp  264  8.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0688  transposase, mutator type  89.59 
 
 
1236 bp  256  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5499    93.7 
 
 
132 bp  188  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.599163  normal  0.0438022 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5761    88.14 
 
 
177 bp  180  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2047    92.24 
 
 
6126 bp  159  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.231348  decreased coverage  0.00652889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2072    92.24 
 
 
1246 bp  159  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0667112  normal  0.0247017 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2883  transposase mutator type  92.24 
 
 
1245 bp  159  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000527688  hitchhiker  0.001163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3557    92.24 
 
 
1246 bp  159  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000455542  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3746    92.24 
 
 
1246 bp  159  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00807242  normal  0.13138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3693    92.24 
 
 
1246 bp  159  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000194072  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3679    92.24 
 
 
1246 bp  159  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.119841  normal  0.0704481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0457    85.88 
 
 
180 bp  153  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4846  transposase, mutator type  87.33 
 
 
1248 bp  147  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0836  transposase, mutator type  87.33 
 
 
1248 bp  147  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.976413  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1035  transposase, mutator type  87.33 
 
 
1248 bp  147  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000123113  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1419  transposase, mutator type  87.33 
 
 
1248 bp  147  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3267  transposase, mutator type  87.33 
 
 
1248 bp  147  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4934  transposase, mutator type  87.33 
 
 
1248 bp  147  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166012  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4917  transposase, mutator type  87.33 
 
 
1248 bp  147  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878139  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1465  transposase, mutator type  87.33 
 
 
1248 bp  147  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1488  transposase, mutator type  87.33 
 
 
1248 bp  147  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685723  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1437  transposase, mutator type  87.33 
 
 
1248 bp  147  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.515564  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0949  transposase, mutator type  87.33 
 
 
1248 bp  147  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0823  transposase, mutator type  87.33 
 
 
1248 bp  147  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0431  transposase, mutator type  87.33 
 
 
1248 bp  147  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.668856  normal  0.200495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0039  transposase, mutator type  87.33 
 
 
1248 bp  147  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290082 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5858  transposase, mutator type  87.33 
 
 
1248 bp  147  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000919553  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5814  transposase, mutator type  87.33 
 
 
1248 bp  147  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242706  hitchhiker  0.000216578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1678  transposase, mutator type  87.33 
 
 
1248 bp  147  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5730  transposase, mutator type  87.33 
 
 
1248 bp  147  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5729  transposase, mutator type  87.33 
 
 
1248 bp  147  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1687  transposase, mutator type  87.33 
 
 
1248 bp  147  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5364  transposase, mutator type  87.33 
 
 
1248 bp  147  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3665    86.09 
 
 
432 bp  133  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1234  transposase mutator type  88.39 
 
 
1248 bp  119  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.199668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1182  transposase mutator type  88.39 
 
 
1248 bp  119  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8623  transposase mutator type  86.44 
 
 
1260 bp  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  0.594548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7079  transposase mutator type  86.44 
 
 
1260 bp  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0221  transposase mutator type  86.44 
 
 
1260 bp  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11065  transposase  85.12 
 
 
1248 bp  97.6  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.540843 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11223  transposase  85.12 
 
 
1248 bp  97.6  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000146016  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12534  transposase  85.12 
 
 
1248 bp  97.6  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.922715  decreased coverage  0.00121453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13039  transposase  85.12 
 
 
1248 bp  97.6  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7584e-95  decreased coverage  0.000658378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13135  transposase  85.12 
 
 
1311 bp  97.6  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.15098 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3032  transposase mutator type  85.71 
 
 
1242 bp  95.6  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4611  transposase mutator type  85.71 
 
 
1242 bp  95.6  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.310217  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2875  hypothetical protein  85.71 
 
 
369 bp  95.6  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.302821 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1707  transposase, mutator type  90 
 
 
189 bp  95.6  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181873  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1371  transposase, mutator type  85.71 
 
 
450 bp  95.6  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13950    94.44 
 
 
123 bp  83.8  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06560  transposase  82.76 
 
 
1248 bp  71.9  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.796022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09270  transposase  82.76 
 
 
1248 bp  71.9  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.681335  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17620  transposase  82.76 
 
 
1248 bp  71.9  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0181204  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25830  transposase  80.54 
 
 
1251 bp  65.9  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17950  transposase  80.54 
 
 
1251 bp  65.9  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.776929  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25910  transposase  80.54 
 
 
1251 bp  65.9  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05430  transposase  80.54 
 
 
1251 bp  65.9  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02400    80.85 
 
 
1318 bp  65.9  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.421042  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01800  transposase  80.85 
 
 
1257 bp  65.9  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16080    90.91 
 
 
333 bp  56  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0352    82.11 
 
 
1213 bp  54  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0058    85.48 
 
 
224 bp  52  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0587  hypothetical protein  96.55 
 
 
336 bp  50.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10260  transposase, mutator family  88.89 
 
 
1254 bp  50.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16140    88.89 
 
 
423 bp  50.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  82.02 
 
 
1200 bp  50.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  82.02 
 
 
1200 bp  50.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4911  transposase, mutator type  100 
 
 
1212 bp  48.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.462522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  100 
 
 
2271 bp  48.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3779  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  48.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688566  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0157  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  48.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0266  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  48.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.598198  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0343  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  48.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0943    87.5 
 
 
3399 bp  48.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0944  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  48.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2394  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  48.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3714  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  48.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3966  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  48.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4031  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  48.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4069  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  48.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.291229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4182  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  48.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644517  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4226  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  48.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5067  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  48.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5445  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  48.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5557  transposase mutator type  87.5 
 
 
1209 bp  48.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.032396 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0014  transposase  96.3 
 
 
927 bp  46.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1573    88.37 
 
 
1271 bp  46.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2565    96.3 
 
 
228 bp  46.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0615    93.55 
 
 
1229 bp  46.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0631  putative transposase  93.55 
 
 
147 bp  46.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13671  transposase  93.55 
 
 
1230 bp  46.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.967269  normal  0.0391652 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0009  transposase  96.3 
 
 
927 bp  46.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>