54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2565 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2565    100 
 
 		 228 bp  452  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0014  transposase  86.77 
 
 		 927 bp  176  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0009  transposase  86.77 
 
 		 927 bp  176  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  84.95 
 
 		 1200 bp  147  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  84.95 
 
 		 1200 bp  147  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3047    83.33 
 
 		 1184 bp  123  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  83.24 
 
 		 1200 bp  121  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  83.24 
 
 		 1200 bp  121  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  83.33 
 
 		 1200 bp  115  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2280    83.63 
 
 		 694 bp  111  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  84.72 
 
 		 1200 bp  111  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  84.72 
 
 		 1200 bp  111  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  84.72 
 
 		 1200 bp  111  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1880    84.03 
 
 		 723 bp  103  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2922    83.33 
 
 		 399 bp  91.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5004    84.96 
 
 		 477 bp  89.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0511261  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0475    83.65 
 
 		 715 bp  71.9  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.920505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  79.68 
 
 		 1200 bp  69.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  79.68 
 
 		 1200 bp  69.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3616  transposase  80.25 
 
 		 288 bp  67.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0170  transposase IS256  82.69 
 
 		 1197 bp  63.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452529  hitchhiker  0.00578172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1760  transposase IS256  82.69 
 
 		 1197 bp  63.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.534749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2225  transposase IS256  82.69 
 
 		 1197 bp  63.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.902645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2744  transposase IS256  82.69 
 
 		 1197 bp  63.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169837  normal  0.196457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3245    82.69 
 
 		 2780 bp  63.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.884067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3246  transposase IS256  82.69 
 
 		 1197 bp  63.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3569  transposase, mutator type  84.15 
 
 		 1209 bp  60  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1374  transposase, mutator type  81.58 
 
 		 1197 bp  60  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2108  transposase, mutator type  84.15 
 
 		 1209 bp  60  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.50702  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3612  transposase, mutator type  84.15 
 
 		 1209 bp  60  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0390226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1065    83.95 
 
 		 1039 bp  58  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3572    81.48 
 
 		 291 bp  56  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8623  transposase mutator type  96.67 
 
 		 1260 bp  52  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  0.594548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7079  transposase mutator type  96.67 
 
 		 1260 bp  52  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0221  transposase mutator type  96.67 
 
 		 1260 bp  52  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0550  transposase, mutator type  90.48 
 
 		 1233 bp  52  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0352    90.48 
 
 		 1213 bp  52  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0899    85.48 
 
 		 2433 bp  52  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.811127 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1573    90.48 
 
 		 1271 bp  52  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0581  transposase, mutator type  90.48 
 
 		 1233 bp  52  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0585  transposase, mutator type  90.48 
 
 		 1233 bp  52  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6213    80.91 
 
 		 2705 bp  52  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3126  transposase, mutator type  82.35 
 
 		 1209 bp  50.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601222  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3172  transposase, mutator type  82.35 
 
 		 1209 bp  50.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15251  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3185  transposase, mutator type  82.35 
 
 		 1209 bp  50.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0504215  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0827  hypothetical protein  90.24 
 
 		 357 bp  50.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4525  IS256 family transposase  80.95 
 
 		 195 bp  50.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3219  transposase, mutator type  82.35 
 
 		 1209 bp  50.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0798  transposase, mutator type  82.35 
 
 		 1209 bp  50.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0790  transposase, mutator type  82.35 
 
 		 1209 bp  50.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1925    100 
 
 		 596 bp  48.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13950    96.43 
 
 		 123 bp  48.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2775    85.45 
 
 		 319 bp  46.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3587    96.3 
 
 		 222 bp  46.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.028456 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>