56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1880 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  93.87 
 
 		 1200 bp  1074    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  90.81 
 
 		 1200 bp  900    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1880    100 
 
 		 723 bp  1433    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  90.81 
 
 		 1200 bp  900    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  88.16 
 
 		 1200 bp  749    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  93.87 
 
 		 1200 bp  1074    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  93.59 
 
 		 1200 bp  1059    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1860  transposase mutator type  97.97 
 
 		 801 bp  537  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.363503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  81.72 
 
 		 1200 bp  343  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  81.72 
 
 		 1200 bp  343  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2280    81.33 
 
 		 694 bp  311  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1065    81.88 
 
 		 1039 bp  301  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3047    81.79 
 
 		 1184 bp  297  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5004    84.97 
 
 		 477 bp  258  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0511261  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0014  transposase  80.16 
 
 		 927 bp  248  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0009  transposase  80.16 
 
 		 927 bp  248  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5006  transposase mutator type  85.26 
 
 		 1014 bp  204  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570221  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0475    84.96 
 
 		 715 bp  178  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.920505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3134    84.26 
 
 		 214 bp  143  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0102047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2775    86.62 
 
 		 319 bp  131  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2128  transposase, mutator type  79.4 
 
 		 468 bp  127  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.449064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3616  transposase  81.59 
 
 		 288 bp  125  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  83.07 
 
 		 1200 bp  121  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  83.07 
 
 		 1200 bp  121  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2922    86.03 
 
 		 399 bp  111  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6213    81.34 
 
 		 2705 bp  105  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2565    84.03 
 
 		 228 bp  103  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2275    85.71 
 
 		 123 bp  101  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5557  transposase mutator type  87.84 
 
 		 1209 bp  75.8  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.032396 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0266  transposase mutator type  87.84 
 
 		 1209 bp  75.8  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.598198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5445  transposase mutator type  87.84 
 
 		 1209 bp  75.8  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5067  transposase mutator type  87.84 
 
 		 1209 bp  75.8  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4226  transposase mutator type  87.84 
 
 		 1209 bp  75.8  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4182  transposase mutator type  87.84 
 
 		 1209 bp  75.8  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4069  transposase mutator type  87.84 
 
 		 1209 bp  75.8  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4031  transposase mutator type  87.84 
 
 		 1209 bp  75.8  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3779  transposase mutator type  87.84 
 
 		 1209 bp  75.8  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688566  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3714  transposase mutator type  87.84 
 
 		 1209 bp  75.8  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2394  transposase mutator type  87.84 
 
 		 1209 bp  75.8  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0944  transposase mutator type  87.84 
 
 		 1209 bp  75.8  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0943    87.84 
 
 		 3399 bp  75.8  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0343  transposase mutator type  87.84 
 
 		 1209 bp  75.8  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0157  transposase mutator type  87.84 
 
 		 1209 bp  75.8  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3966  transposase mutator type  87.84 
 
 		 1209 bp  75.8  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2225  transposase IS256  83.17 
 
 		 1197 bp  65.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.902645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3246  transposase IS256  83.17 
 
 		 1197 bp  65.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3245    83.17 
 
 		 2780 bp  65.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.884067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2744  transposase IS256  83.17 
 
 		 1197 bp  65.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169837  normal  0.196457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1760  transposase IS256  83.17 
 
 		 1197 bp  65.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.534749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0170  transposase IS256  83.17 
 
 		 1197 bp  65.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452529  hitchhiker  0.00578172 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4911  transposase, mutator type  81.58 
 
 		 1212 bp  60  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.462522 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3572    90.91 
 
 		 291 bp  56  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3185  transposase, mutator type  80.31 
 
 		 1209 bp  54  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0504215  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3172  transposase, mutator type  80.31 
 
 		 1209 bp  54  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15251  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3126  transposase, mutator type  80.31 
 
 		 1209 bp  54  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601222  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1573    86.21 
 
 		 1271 bp  52  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>