29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2881 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4611  transposase mutator type  99.48 
 
 		 1242 bp  1499    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.310217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3032  transposase mutator type  99.48 
 
 		 1242 bp  1499    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2881    100 
 
 		 783 bp  1552    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1368  transposase mutator type  99.62 
 
 		 1623 bp  1528    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2883  transposase mutator type  82.74 
 
 		 1245 bp  121  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000527688  hitchhiker  0.001163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2072    82.74 
 
 		 1246 bp  121  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0667112  normal  0.0247017 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2047    82.74 
 
 		 6126 bp  121  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.231348  decreased coverage  0.00652889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3557    82.74 
 
 		 1246 bp  121  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000455542  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3679    82.74 
 
 		 1246 bp  121  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.119841  normal  0.0704481 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3746    82.74 
 
 		 1246 bp  121  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00807242  normal  0.13138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3693    82.74 
 
 		 1246 bp  121  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000194072  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13135  transposase  95.24 
 
 		 1311 bp  101  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.15098 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12681  hypothetical protein  95.24 
 
 		 804 bp  101  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.001544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12534  transposase  95.24 
 
 		 1248 bp  101  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.922715  decreased coverage  0.00121453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11223  transposase  95.24 
 
 		 1248 bp  101  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000146016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11065  transposase  95.24 
 
 		 1248 bp  101  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.540843 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13039  transposase  95.24 
 
 		 1248 bp  101  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7584e-95  decreased coverage  0.000658378 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1182  transposase mutator type  85.45 
 
 		 1248 bp  91.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1234  transposase mutator type  85.45 
 
 		 1248 bp  91.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.199668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0221  transposase mutator type  81.51 
 
 		 1260 bp  61.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7079  transposase mutator type  81.51 
 
 		 1260 bp  61.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8623  transposase mutator type  81.51 
 
 		 1260 bp  61.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  0.594548 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20500  transposase, mutator family  89.8 
 
 		 1254 bp  58  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05430  transposase, mutator family  89.8 
 
 		 1254 bp  58  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.236758  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03400  transposase, mutator family  89.13 
 
 		 1254 bp  52  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0454  transposase, mutator type  82.56 
 
 		 1062 bp  52  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5496  transposase, mutator type  90.48 
 
 		 1062 bp  52  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512335 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5356  transposase, mutator type  93.75 
 
 		 1287 bp  48.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0688  transposase, mutator type  81.25 
 
 		 1236 bp  48.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>