18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0401 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0401    100 
 
 
234 bp  464  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2072    94.19 
 
 
1246 bp  262  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0667112  normal  0.0247017 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2047    94.19 
 
 
6126 bp  262  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.231348  decreased coverage  0.00652889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3679    93.6 
 
 
1246 bp  254  9.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.119841  normal  0.0704481 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3557    93.6 
 
 
1246 bp  254  9.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000455542  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2883  transposase mutator type  93.6 
 
 
1245 bp  254  9.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000527688  hitchhiker  0.001163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1234  transposase mutator type  93.6 
 
 
1248 bp  254  9.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.199668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1182  transposase mutator type  93.6 
 
 
1248 bp  254  9.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3746    93.02 
 
 
1246 bp  246  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00807242  normal  0.13138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3693    93.02 
 
 
1246 bp  246  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000194072  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5356  transposase, mutator type  84.43 
 
 
1287 bp  91.7  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116782  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3590  transposase, mutator type  85.05 
 
 
1113 bp  85.7  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0127182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0454  transposase, mutator type  83.61 
 
 
1062 bp  83.8  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2876  transposase, mutator type  89.39 
 
 
1287 bp  75.8  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0889  transposase, mutator type  89.39 
 
 
1287 bp  75.8  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0700  transposase, mutator type  89.39 
 
 
1287 bp  75.8  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5496  transposase, mutator type  83.18 
 
 
1062 bp  69.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0512335 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0688  transposase, mutator type  80.99 
 
 
1236 bp  58  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>