More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1859 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0375  transposase mutator type  100 
 
 
410 aa  823    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2905  transposase mutator type  100 
 
 
410 aa  823    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1859  transposase mutator type  100 
 
 
410 aa  823    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2636  transposase mutator type  100 
 
 
410 aa  823    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0550  transposase, mutator type  80.79 
 
 
410 aa  676    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0581  transposase, mutator type  80.79 
 
 
410 aa  676    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0585  transposase, mutator type  80.79 
 
 
410 aa  676    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390159  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5755  transposase, mutator type  63.75 
 
 
411 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431676  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5359  transposase, mutator type  63.75 
 
 
411 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.502156  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0678  transposase, mutator type  62.98 
 
 
411 aa  494  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3191  transposase, mutator type  62.98 
 
 
411 aa  494  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.317024  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13671  transposase  60.25 
 
 
409 aa  483  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.967269  normal  0.0391652 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0112  transposase mutator type  56.78 
 
 
405 aa  432  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1531  transposase mutator type  56.78 
 
 
405 aa  432  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1904  transposase mutator type  56.78 
 
 
405 aa  432  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1511  transposase mutator type  56.78 
 
 
405 aa  432  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.647595  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1513  transposase mutator type  56.78 
 
 
405 aa  432  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.688883  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3132  transposase mutator type  56.78 
 
 
405 aa  432  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1539  transposase mutator type  56.78 
 
 
405 aa  432  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5576  transposase, mutator type  61.83 
 
 
400 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5979  transposase, mutator type  61.83 
 
 
391 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.640572 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10460  Transposase, Mutator family  51.55 
 
 
422 aa  410  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000746086  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10440  Transposase, Mutator family  51.55 
 
 
422 aa  410  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000572407  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0630  transposase, mutator type  60.12 
 
 
361 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2816  transposase, mutator type  54.73 
 
 
406 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2672  transposase, mutator type  54.73 
 
 
406 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2958  transposase, mutator type  54.73 
 
 
406 aa  386  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2201  transposase, mutator type  54.73 
 
 
406 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2017  transposase, mutator type  54.73 
 
 
406 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0292  transposase, mutator type  54.73 
 
 
406 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0587  transposase, mutator type  54.73 
 
 
406 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0594  transposase, mutator type  54.73 
 
 
406 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1889  transposase, mutator type  54.73 
 
 
406 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3185  transposase, mutator type  51.01 
 
 
402 aa  378  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0504215  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3172  transposase, mutator type  51.01 
 
 
402 aa  378  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15251  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3219  transposase, mutator type  51.01 
 
 
402 aa  378  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0790  transposase, mutator type  51.01 
 
 
402 aa  378  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0798  transposase, mutator type  51.01 
 
 
402 aa  377  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3126  transposase, mutator type  50.75 
 
 
402 aa  376  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601222  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4911  transposase, mutator type  50.65 
 
 
403 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.462522 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5557  transposase mutator type  51.54 
 
 
402 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.032396 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0343  transposase mutator type  51.54 
 
 
402 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0944  transposase mutator type  51.54 
 
 
402 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5067  transposase mutator type  51.54 
 
 
402 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4226  transposase mutator type  51.54 
 
 
402 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5445  transposase mutator type  51.54 
 
 
402 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2394  transposase mutator type  51.54 
 
 
402 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3714  transposase mutator type  51.54 
 
 
402 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4069  transposase mutator type  51.54 
 
 
402 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.291229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4031  transposase mutator type  51.54 
 
 
402 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3779  transposase mutator type  51.54 
 
 
402 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688566  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3966  transposase mutator type  51.54 
 
 
402 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4182  transposase mutator type  51.54 
 
 
402 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644517  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  54.13 
 
 
399 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0157  transposase mutator type  51.54 
 
 
402 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0266  transposase mutator type  51.54 
 
 
402 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.598198  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  51.81 
 
 
399 aa  363  4e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  51.81 
 
 
399 aa  363  4e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  53.33 
 
 
399 aa  360  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2108  transposase, mutator type  51.28 
 
 
402 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.50702  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3612  transposase, mutator type  51.28 
 
 
402 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0390226  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3569  transposase, mutator type  51.28 
 
 
402 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0221  transposase mutator type  51.62 
 
 
419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8623  transposase mutator type  51.62 
 
 
419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  0.594548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  53.07 
 
 
399 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  53.07 
 
 
399 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7079  transposase mutator type  51.35 
 
 
419 aa  356  5e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  53.63 
 
 
399 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  53.63 
 
 
399 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5356  transposase, mutator type  52.6 
 
 
428 aa  352  5e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116782  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13468  transposase  65.28 
 
 
281 aa  352  8e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0327912  hitchhiker  0.000514012 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0700  transposase, mutator type  50.65 
 
 
428 aa  349  7e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0889  transposase, mutator type  50.65 
 
 
428 aa  349  7e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2876  transposase, mutator type  50.65 
 
 
428 aa  349  7e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0170  transposase IS256  47.84 
 
 
398 aa  348  1e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452529  hitchhiker  0.00578172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2744  transposase IS256  47.84 
 
 
398 aa  347  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169837  normal  0.196457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3246  transposase IS256  47.84 
 
 
398 aa  347  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1760  transposase IS256  47.84 
 
 
398 aa  347  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.534749  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2225  transposase IS256  47.84 
 
 
398 aa  347  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.902645 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0688  transposase, mutator type  49.36 
 
 
411 aa  347  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1234  transposase mutator type  50.27 
 
 
415 aa  345  7e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.199668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1182  transposase mutator type  50.27 
 
 
415 aa  345  7e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1374  transposase, mutator type  50.53 
 
 
398 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00300  transposase, mutator family  48.84 
 
 
417 aa  342  5.999999999999999e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03110  transposase, mutator family  48.84 
 
 
417 aa  342  5.999999999999999e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.529932  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12170  transposase, mutator family  48.84 
 
 
417 aa  342  5.999999999999999e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12080  transposase, mutator family  48.84 
 
 
417 aa  342  5.999999999999999e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0258594  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00410  transposase, mutator family  48.84 
 
 
417 aa  342  5.999999999999999e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00420  transposase, mutator family  48.84 
 
 
417 aa  342  5.999999999999999e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02160  transposase, mutator family  48.84 
 
 
417 aa  342  8e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20590  transposase, mutator family  48.84 
 
 
417 aa  342  8e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2883  transposase mutator type  49.73 
 
 
414 aa  340  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000527688  hitchhiker  0.001163 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16090  transposase  49.08 
 
 
390 aa  338  8e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.559374  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20500  transposase, mutator family  48.59 
 
 
417 aa  338  9e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05430  transposase, mutator family  48.59 
 
 
417 aa  338  9e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.236758  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03400  transposase, mutator family  48.59 
 
 
417 aa  338  9.999999999999999e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  51.2 
 
 
399 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  51.2 
 
 
399 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3267  transposase, mutator type  50.14 
 
 
415 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5364  transposase, mutator type  48.48 
 
 
415 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>