22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4125 on replicon NC_009040
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009040  Rsph17029_4125    100 
 
 		 213 bp  422  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2108  transposase, mutator type  85.94 
 
 		 1209 bp  111  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.50702  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3569  transposase, mutator type  85.94 
 
 		 1209 bp  111  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3612  transposase, mutator type  85.94 
 
 		 1209 bp  111  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0390226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3382  hypothetical protein  86.92 
 
 		 324 bp  101  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4918  hypothetical protein  85.12 
 
 		 477 bp  97.6  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3126  transposase, mutator type  83.59 
 
 		 1209 bp  87.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601222  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3172  transposase, mutator type  83.59 
 
 		 1209 bp  87.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15251  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3185  transposase, mutator type  83.59 
 
 		 1209 bp  87.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0504215  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3219  transposase, mutator type  83.47 
 
 		 1209 bp  81.8  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0798  transposase, mutator type  83.19 
 
 		 1209 bp  77.8  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0790  transposase, mutator type  85.11 
 
 		 1209 bp  75.8  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4911  transposase, mutator type  82.73 
 
 		 1212 bp  67.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.462522 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1413  integrase catalytic subunit  89.29 
 
 		 1200 bp  63.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0014  transposase  86.15 
 
 		 927 bp  58  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0009  transposase  86.15 
 
 		 927 bp  58  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2922    80.49 
 
 		 399 bp  46.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2703  amino acid carrier protein  100 
 
 		 1395 bp  46.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0375  transposase mutator type  84.13 
 
 		 1233 bp  46.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1859  transposase mutator type  84.13 
 
 		 1233 bp  46.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2636  transposase mutator type  84.13 
 
 		 1233 bp  46.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2905  transposase mutator type  84.13 
 
 		 1233 bp  46.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>