95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0700 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0700  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 		 171 aa  327  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0739  Disulphide bond formation protein DsbB  83.87 
 
 		 174 aa  223  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0726  disulphide bond formation protein DsbB  92.05 
 
 		 170 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.767254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0047  disulphide bond formation protein DsbB  63.64 
 
 		 162 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5956  Disulphide bond formation protein DsbB  71.9 
 
 		 167 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745885  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5213  disulphide bond formation protein DsbB  71.43 
 
 		 178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361204  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2965  hypothetical protein  49.71 
 
 		 171 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0758  hypothetical protein  47.2 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3552  hypothetical protein  44.81 
 
 		 171 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239069  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3844  disulphide bond formation protein DsbB  45.27 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3023  hypothetical protein  46.34 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786001  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2523  hypothetical protein  48.92 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.580501 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4000  hypothetical protein  45.39 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1642  disulfide bond formation protein B, putative  44.85 
 
 		 172 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1590  putative disulfide bond formation protein B  44.85 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.523994  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1273  disulfide bond formation protein B, putative  43.07 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0627  hypothetical protein  46.56 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3845  hypothetical protein  44.81 
 
 		 171 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1095  putative disulfide bond formation protein B (disulfide oxidoreductase) (dsbB)  49.58 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432529  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1635  disulphide bond formation protein DsbB  45.86 
 
 		 176 aa  99.4  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0182  DsbB domain-containing protein  39.57 
 
 		 190 aa  95.1  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3497  disulphide bond formation protein DsbB  47.2 
 
 		 190 aa  94.7  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0738  hypothetical protein  45.52 
 
 		 174 aa  94.7  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0181404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0326  hypothetical protein  45.38 
 
 		 181 aa  94.4  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3197  hypothetical protein  42.36 
 
 		 201 aa  88.2  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.700851  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0542  disulphide bond formation protein DsbB  45.08 
 
 		 182 aa  88.2  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3866  disulphide bond formation protein DsbB  38.69 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2347  disulphide bond formation protein DsbB  35.57 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1167  disulphide bond formation protein DsbB  38.51 
 
 		 157 aa  80.5  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.022846 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2493  disulphide bond formation protein DsbB  36.36 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00516878  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3597  disulphide bond formation protein DsbB  35.66 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0122638  normal  0.112725 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3935  disulphide bond formation protein DsbB  35.66 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0499  hypothetical protein  39.74 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0340  DsbB family disulfide bond formation protein  27.22 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00348153  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0909  disulphide bond formation protein DsbB  35.66 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0312891 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0573  disulfide bond formation protein  37.5 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0054  disulphide bond formation protein DsbB  37.01 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2929  putative disulfide bond formation protein DsbB  38.14 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238011  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3497  disulphide bond formation protein DsbB  38.06 
 
 		 177 aa  62  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00411983  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1478  disulphide bond formation protein DsbB  33.61 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.235403  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2548  disulfide bond formation protein DsbB-like protein  34.68 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  30.59 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1105  hypothetical protein  49.28 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165888  normal  0.399905 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1575  disulphide bond formation protein DsbB  37.29 
 
 		 154 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0166322  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2001  disulfide bond formation protein B  29.45 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0912116  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2365  disulfide bond formation protein B  29.45 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00370125  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2111  disulfide bond formation protein B  28.92 
 
 		 213 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0224  disulfide bond formation protein DsbB  25.38 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0874  disulfide bond formation family protein  25.55 
 
 		 157 aa  51.2  0.000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0761  disulphide bond formation protein DsbB  24.82 
 
 		 168 aa  50.8  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002977  thiol:disulfide oxidoreductase DsbB required for DsbA reoxidation  27.27 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2001  disulfide bond formation protein B  25.88 
 
 		 176 aa  48.1  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000986099  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0034  disulfide bond formation protein  30.14 
 
 		 176 aa  48.1  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1099  DsbB family disulfide bond formation protein  28.66 
 
 		 173 aa  47.8  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0042  disulphide bond formation protein DsbB  30.14 
 
 		 176 aa  47.8  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  29.17 
 
 		 168 aa  47.8  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1343  disulfide bond formation protein B  26.86 
 
 		 176 aa  47.4  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000257632  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1672  disulfide bond formation protein B  26.86 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1964  disulfide bond formation protein B  26.86 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000143241  normal  0.740746 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2440  disulfide bond formation protein B  26.86 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000139954  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2463  Disulphide bond formation protein DsbB  26.86 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.15548e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01170  hypothetical protein  26.86 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2750  disulfide bond formation protein B  27.65 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229834  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01160  disulfide bond formation protein B  26.86 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2367  disulfide bond formation protein B  26.59 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000380886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1330  disulfide bond formation protein B  26.86 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000164029  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1288  disulfide bond formation protein B  26.86 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  9.7249e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02931  disulfide bond formation protein B  26.28 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0624  disulfide bond formation protein B  27.39 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000750855  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0152  disulphide bond formation protein DsbB  41.33 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  29.49 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0468  disulphide bond formation protein DsbB  33.09 
 
 		 168 aa  44.3  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0356503  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1492  disulfide bond formation protein B  29.45 
 
 		 173 aa  44.3  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.028843  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2149  disulfide bond formation protein B  24.83 
 
 		 171 aa  44.3  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1949  disulfide bond formation protein B  27.59 
 
 		 176 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.291757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1511  disulfide bond formation protein B  27.59 
 
 		 176 aa  44.3  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.301751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  28.31 
 
 		 167 aa  44.3  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1326  disulfide bond formation protein B  27.59 
 
 		 176 aa  44.3  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000420018  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2005  disulfide bond formation protein B  27.59 
 
 		 176 aa  44.3  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  0.704676 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1945  disulfide bond formation protein B  27.59 
 
 		 176 aa  44.3  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0468661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0045  disulphide bond formation protein DsbB  25.85 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  27.81 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01146  disulfide bond formation protein B (Disulfide oxidoreductase)  25.36 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0870  disulphide bond formation protein DsbB  27.66 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  29.87 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1769  disulfide bond formation protein B  23.91 
 
 		 179 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00798262  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  29.05 
 
 		 174 aa  41.6  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0782  disulfide bond formation protein B  29.01 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.136765  normal  0.0551075 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  30.56 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1776  disulfide bond formation protein B  23.91 
 
 		 179 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000776232  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2509  disulfide bond formation protein B  23.91 
 
 		 175 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00306638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2556  disulfide bond formation protein B  46.94 
 
 		 175 aa  41.6  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.885142  normal  0.87532 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1882  disulfide bond formation protein B  26.06 
 
 		 173 aa  41.6  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0159786  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0019  disulfide bond formation protein B  27.37 
 
 		 136 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000650277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1813  disulfide bond formation protein B  23.91 
 
 		 179 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0184857  normal  0.431807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>