68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1095 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1095  putative disulfide bond formation protein B (disulfide oxidoreductase) (dsbB)  100 
 
 		 165 aa  314  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432529  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0542  disulphide bond formation protein DsbB  61.59 
 
 		 182 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0326  hypothetical protein  63.77 
 
 		 181 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3497  disulphide bond formation protein DsbB  66.41 
 
 		 190 aa  167  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0738  hypothetical protein  65.41 
 
 		 174 aa  166  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0181404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0627  hypothetical protein  64.43 
 
 		 188 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0499  hypothetical protein  61.15 
 
 		 181 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0758  hypothetical protein  48.03 
 
 		 167 aa  130  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2965  hypothetical protein  48.82 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3844  disulphide bond formation protein DsbB  47.8 
 
 		 162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3552  hypothetical protein  42.68 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239069  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0047  disulphide bond formation protein DsbB  44.87 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1273  disulfide bond formation protein B, putative  39.88 
 
 		 174 aa  98.2  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4000  hypothetical protein  39.02 
 
 		 170 aa  97.1  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1167  disulphide bond formation protein DsbB  42.28 
 
 		 157 aa  94  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.022846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3845  hypothetical protein  40 
 
 		 171 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0739  Disulphide bond formation protein DsbB  48.03 
 
 		 174 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0700  disulphide bond formation protein DsbB  48.03 
 
 		 171 aa  90.5  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3023  hypothetical protein  38.41 
 
 		 179 aa  89  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786001  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1635  disulphide bond formation protein DsbB  41.61 
 
 		 176 aa  86.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1590  putative disulfide bond formation protein B  36.42 
 
 		 172 aa  85.5  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.523994  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1642  disulfide bond formation protein B, putative  35.8 
 
 		 172 aa  84.7  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1478  disulphide bond formation protein DsbB  40.13 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.235403  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5956  Disulphide bond formation protein DsbB  45.97 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745885  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0726  disulphide bond formation protein DsbB  48.82 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.767254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5213  disulphide bond formation protein DsbB  42.74 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361204  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2548  disulfide bond formation protein DsbB-like protein  39.58 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2523  hypothetical protein  39.73 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.580501 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2347  disulphide bond formation protein DsbB  34.36 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2929  putative disulfide bond formation protein DsbB  41.8 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238011  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0054  disulphide bond formation protein DsbB  40.15 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3497  disulphide bond formation protein DsbB  35.29 
 
 		 177 aa  70.9  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00411983  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0573  disulfide bond formation protein  41.09 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3866  disulphide bond formation protein DsbB  37.5 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0909  disulphide bond formation protein DsbB  40 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0312891 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2493  disulphide bond formation protein DsbB  33.58 
 
 		 157 aa  67  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00516878  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3935  disulphide bond formation protein DsbB  35.38 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3597  disulphide bond formation protein DsbB  35.38 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0122638  normal  0.112725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3197  hypothetical protein  37.78 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.700851  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1575  disulphide bond formation protein DsbB  40.98 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0166322  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0182  DsbB domain-containing protein  31.62 
 
 		 190 aa  57.4  0.00000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  32.89 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  32.41 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1882  disulfide bond formation protein B  31.01 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0159786  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0340  DsbB family disulfide bond formation protein  25 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00348153  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1805  disulfide bond formation protein B  32.56 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0937244  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1105  hypothetical protein  38 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165888  normal  0.399905 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  31.82 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1633  disulfide bond formation protein B  29.5 
 
 		 175 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230127  normal  0.158869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1641  disulfide bond formation protein B  29.5 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.27024  hitchhiker  0.00453379 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1776  disulfide bond formation protein B  28.78 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000776232  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1566  disulfide bond formation protein B  29.5 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244803  normal  0.842477 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4377  disulfide bond formation protein B  31.68 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0874  disulfide bond formation family protein  26.52 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2887  disulfide bond formation protein B  27.74 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1813  disulfide bond formation protein B  28.06 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0184857  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1769  disulfide bond formation protein B  27.34 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00798262  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2957  Disulphide bond formation protein DsbB  34 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  31.25 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2509  disulfide bond formation protein B  27.34 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00306638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  32.24 
 
 		 175 aa  44.7  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4650  disulfide bond formation protein B  34.52 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1681  disulfide bond formation protein B  27.86 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.058826  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3300  Disulphide bond formation protein DsbB  30.26 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  30.92 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0468  disulphide bond formation protein DsbB  35.57 
 
 		 168 aa  41.2  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0356503  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1140  disulfide bond formation protein B  40.3 
 
 		 169 aa  41.2  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  30 
 
 		 168 aa  40.4  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>