46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2523 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2523  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  347  5e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.580501 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3552  hypothetical protein  58.82 
 
 		 171 aa  217  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239069  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3845  hypothetical protein  60.48 
 
 		 171 aa  208  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4000  hypothetical protein  59.74 
 
 		 170 aa  182  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1273  disulfide bond formation protein B, putative  50 
 
 		 174 aa  155  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3023  hypothetical protein  55 
 
 		 179 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786001  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1642  disulfide bond formation protein B, putative  48.73 
 
 		 172 aa  147  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1590  putative disulfide bond formation protein B  48.1 
 
 		 172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.523994  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0182  DsbB domain-containing protein  39.16 
 
 		 190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3844  disulphide bond formation protein DsbB  40.99 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0758  hypothetical protein  43.7 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0047  disulphide bond formation protein DsbB  44.44 
 
 		 162 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0739  Disulphide bond formation protein DsbB  48.82 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0700  disulphide bond formation protein DsbB  47.24 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0726  disulphide bond formation protein DsbB  48.82 
 
 		 170 aa  102  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.767254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0542  disulphide bond formation protein DsbB  43.44 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5213  disulphide bond formation protein DsbB  50 
 
 		 178 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361204  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2965  hypothetical protein  40.56 
 
 		 171 aa  94.4  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5956  Disulphide bond formation protein DsbB  45.16 
 
 		 167 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745885  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0627  hypothetical protein  40.31 
 
 		 188 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3197  hypothetical protein  41.1 
 
 		 201 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.700851  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1635  disulphide bond formation protein DsbB  39.01 
 
 		 176 aa  85.9  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1095  putative disulfide bond formation protein B (disulfide oxidoreductase) (dsbB)  43.38 
 
 		 165 aa  84.3  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432529  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2347  disulphide bond formation protein DsbB  34.9 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0326  hypothetical protein  41.38 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1167  disulphide bond formation protein DsbB  35.06 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.022846 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2493  disulphide bond formation protein DsbB  35.51 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00516878  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0499  hypothetical protein  39.42 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3497  disulphide bond formation protein DsbB  39.67 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0738  hypothetical protein  36.67 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0181404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3866  disulphide bond formation protein DsbB  35.81 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2929  putative disulfide bond formation protein DsbB  33.87 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238011  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3935  disulphide bond formation protein DsbB  37.23 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3597  disulphide bond formation protein DsbB  37.23 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0122638  normal  0.112725 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1478  disulphide bond formation protein DsbB  37.76 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.235403  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2548  disulfide bond formation protein DsbB-like protein  35.04 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1575  disulphide bond formation protein DsbB  33.87 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0166322  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0909  disulphide bond formation protein DsbB  33.78 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0312891 
 
 
-
 
NC_002978  WD1099  DsbB family disulfide bond formation protein  31.03 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3497  disulphide bond formation protein DsbB  33.08 
 
 		 177 aa  51.6  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00411983  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0340  DsbB family disulfide bond formation protein  25.69 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00348153  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0573  disulfide bond formation protein  33.82 
 
 		 160 aa  48.1  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0054  disulphide bond formation protein DsbB  31.65 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0874  disulfide bond formation family protein  23.4 
 
 		 157 aa  44.3  0.0008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1105  hypothetical protein  37.33 
 
 		 161 aa  42.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165888  normal  0.399905 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0224  disulfide bond formation protein DsbB  25 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>