34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1105 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1105  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  306  6.999999999999999e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165888  normal  0.399905 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0152  disulphide bond formation protein DsbB  38.89 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0758  hypothetical protein  36.29 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0874  disulfide bond formation family protein  25.16 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1478  disulphide bond formation protein DsbB  36.76 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.235403  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1167  disulphide bond formation protein DsbB  35.59 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.022846 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2493  disulphide bond formation protein DsbB  37.68 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00516878  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1635  disulphide bond formation protein DsbB  40.86 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0340  DsbB family disulfide bond formation protein  25.16 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00348153  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2965  hypothetical protein  34.68 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_004310  BR1642  disulfide bond formation protein B, putative  33.33 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3844  disulphide bond formation protein DsbB  34.57 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1590  putative disulfide bond formation protein B  33.33 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.523994  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3597  disulphide bond formation protein DsbB  26.21 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0122638  normal  0.112725 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3935  disulphide bond formation protein DsbB  26.21 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0224  disulfide bond formation protein DsbB  31.25 
 
 		 159 aa  51.2  0.000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2929  putative disulfide bond formation protein DsbB  35.4 
 
 		 154 aa  50.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238011  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2548  disulfide bond formation protein DsbB-like protein  29.91 
 
 		 217 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1095  putative disulfide bond formation protein B (disulfide oxidoreductase) (dsbB)  38 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432529  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0739  Disulphide bond formation protein DsbB  47.83 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0700  disulphide bond formation protein DsbB  49.28 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0047  disulphide bond formation protein DsbB  40.48 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0182  DsbB domain-containing protein  29.09 
 
 		 190 aa  47.8  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1273  disulfide bond formation protein B, putative  30.37 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0726  disulphide bond formation protein DsbB  47.83 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.767254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1575  disulphide bond formation protein DsbB  33.63 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0166322  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3552  hypothetical protein  29.35 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239069  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_002978  WD1099  DsbB family disulfide bond formation protein  26.28 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3866  disulphide bond formation protein DsbB  30.67 
 
 		 164 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3497  disulphide bond formation protein DsbB  32.54 
 
 		 177 aa  41.6  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00411983  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0909  disulphide bond formation protein DsbB  31.15 
 
 		 154 aa  41.2  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0312891 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0627  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3023  hypothetical protein  32.76 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786001  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5956  Disulphide bond formation protein DsbB  46.38 
 
 		 167 aa  40.8  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>