42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0340 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0340  DsbB family disulfide bond formation protein  100 
 
 
165 aa  335  9.999999999999999e-92  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00348153  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1099  DsbB family disulfide bond formation protein  35.66 
 
 
173 aa  84  8e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1167  disulphide bond formation protein DsbB  29.8 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.022846 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3866  disulphide bond formation protein DsbB  29.33 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0758  hypothetical protein  29.61 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0054  disulphide bond formation protein DsbB  32.17 
 
 
160 aa  60.8  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0047  disulphide bond formation protein DsbB  28.86 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1478  disulphide bond formation protein DsbB  28.37 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.235403  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2965  hypothetical protein  27.97 
 
 
171 aa  58.9  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3497  disulphide bond formation protein DsbB  27.94 
 
 
177 aa  58.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00411983  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2548  disulfide bond formation protein DsbB-like protein  25.83 
 
 
217 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0573  disulfide bond formation protein  31.3 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0542  disulphide bond formation protein DsbB  28.36 
 
 
182 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0874  disulfide bond formation family protein  26.85 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1105  hypothetical protein  24.82 
 
 
161 aa  53.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165888  normal  0.399905 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1095  putative disulfide bond formation protein B (disulfide oxidoreductase) (dsbB)  25 
 
 
165 aa  52.4  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432529  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2929  putative disulfide bond formation protein DsbB  24.35 
 
 
154 aa  52  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238011  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0326  hypothetical protein  28.45 
 
 
181 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1273  disulfide bond formation protein B, putative  28.57 
 
 
174 aa  51.6  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0909  disulphide bond formation protein DsbB  24.24 
 
 
154 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0312891 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0224  disulfide bond formation protein DsbB  27.82 
 
 
159 aa  50.4  0.000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3552  hypothetical protein  28.48 
 
 
171 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239069  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2493  disulphide bond formation protein DsbB  24.75 
 
 
157 aa  48.9  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00516878  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0700  disulphide bond formation protein DsbB  27.97 
 
 
171 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1575  disulphide bond formation protein DsbB  23.15 
 
 
154 aa  48.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0166322  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1590  putative disulfide bond formation protein B  30.25 
 
 
172 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.523994  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1642  disulfide bond formation protein B, putative  29.41 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3844  disulphide bond formation protein DsbB  25 
 
 
162 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5956  Disulphide bond formation protein DsbB  25.62 
 
 
167 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745885  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0627  hypothetical protein  26.72 
 
 
188 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0739  Disulphide bond formation protein DsbB  25.42 
 
 
174 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2523  hypothetical protein  25.69 
 
 
174 aa  44.7  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.580501 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3497  disulphide bond formation protein DsbB  27.78 
 
 
190 aa  44.7  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2347  disulphide bond formation protein DsbB  29.22 
 
 
175 aa  44.7  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3845  hypothetical protein  28.48 
 
 
171 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0726  disulphide bond formation protein DsbB  24.58 
 
 
170 aa  42.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.767254  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0738  hypothetical protein  26.72 
 
 
174 aa  42.4  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0181404  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1635  disulphide bond formation protein DsbB  23.33 
 
 
176 aa  41.6  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0152  disulphide bond formation protein DsbB  29.91 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4000  hypothetical protein  23.44 
 
 
170 aa  41.2  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5213  disulphide bond formation protein DsbB  25.21 
 
 
178 aa  40.8  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361204  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0499  hypothetical protein  21.43 
 
 
181 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>