45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2347 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2347  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 
175 aa  351  2e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3844  disulphide bond formation protein DsbB  42.28 
 
 
162 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1167  disulphide bond formation protein DsbB  40.82 
 
 
157 aa  97.8  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.022846 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1478  disulphide bond formation protein DsbB  40.28 
 
 
155 aa  91.3  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.235403  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1635  disulphide bond formation protein DsbB  38.31 
 
 
176 aa  89  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0909  disulphide bond formation protein DsbB  40.14 
 
 
154 aa  88.2  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0312891 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2929  putative disulfide bond formation protein DsbB  41.27 
 
 
154 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238011  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3552  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239069  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0738  hypothetical protein  37.23 
 
 
174 aa  82  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0181404  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4000  hypothetical protein  35.81 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0542  disulphide bond formation protein DsbB  36.03 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3497  disulphide bond formation protein DsbB  36.5 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2523  hypothetical protein  34.9 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.580501 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3935  disulphide bond formation protein DsbB  35.61 
 
 
170 aa  77.4  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3597  disulphide bond formation protein DsbB  35.61 
 
 
170 aa  77.4  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0122638  normal  0.112725 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3023  hypothetical protein  34.88 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786001  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3866  disulphide bond formation protein DsbB  32.69 
 
 
164 aa  77.4  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3197  hypothetical protein  32.48 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.700851  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3845  hypothetical protein  33.14 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1575  disulphide bond formation protein DsbB  40.32 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0166322  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1095  putative disulfide bond formation protein B (disulfide oxidoreductase) (dsbB)  34.81 
 
 
165 aa  73.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432529  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0627  hypothetical protein  33.85 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0758  hypothetical protein  34.57 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0182  DsbB domain-containing protein  30.77 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0326  hypothetical protein  32.82 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2493  disulphide bond formation protein DsbB  35.94 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00516878  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0054  disulphide bond formation protein DsbB  37.86 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5956  Disulphide bond formation protein DsbB  36 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745885  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2548  disulfide bond formation protein DsbB-like protein  39.69 
 
 
217 aa  68.2  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2965  hypothetical protein  32.93 
 
 
171 aa  67  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0700  disulphide bond formation protein DsbB  35.94 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0047  disulphide bond formation protein DsbB  35.51 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5213  disulphide bond formation protein DsbB  36 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361204  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0739  Disulphide bond formation protein DsbB  36.8 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1642  disulfide bond formation protein B, putative  31.88 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1590  putative disulfide bond formation protein B  31.88 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.523994  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0499  hypothetical protein  30.71 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1273  disulfide bond formation protein B, putative  29.2 
 
 
174 aa  61.2  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0726  disulphide bond formation protein DsbB  36 
 
 
170 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.767254  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0573  disulfide bond formation protein  44.12 
 
 
160 aa  58.9  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3497  disulphide bond formation protein DsbB  28.67 
 
 
177 aa  48.9  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00411983  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0340  DsbB family disulfide bond formation protein  29.22 
 
 
165 aa  44.7  0.0008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00348153  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2691  disulfide bond formation protein B  29.11 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000294501  normal  0.182741 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0761  disulphide bond formation protein DsbB  27.52 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1776  disulfide bond formation protein B  28.1 
 
 
179 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000776232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>